KHDRBS3

KHDRBS3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3
Ідентифікатори
Символи	KHDRBS3, Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3
Зовнішні ІД	OMIM: 610421 MGI: 1313312 HomoloGene: 4780 GeneCards: KHDRBS3
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • protein domain specific binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • mRNA processing • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • protein complex oligomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10656	13992
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000022332
UniProt	O75525	Q9R226
RefSeq (мРНК)	NM_006558	NM_010158
RefSeq (білок)	NP_006549	NP_034288
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 15: 68.8 – 68.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KHDRBS3 (англ. KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 38 800.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEKYLPELM		AEKDSLDPSF		THALRLVNQE		IEKFQKGEGK		DEEKYIDVVI
NKNMKLGQKV		LIPVKQFPKF		NFVGKLLGPR		GNSLKRLQEE		TLTKMSILGK
GSMRDKAKEE		ELRKSGEAKY		FHLNDDLHVL		IEVFAPPAEA		YARMGHALEE
IKKFLIPDYN		DEIRQAQLQE		LTYLNGGSEN		ADVPVVRGKP		TLRTRGVPAP
AITRGRGGVT		ARPVGVVVPR		GTPTPRGVLS		TRGPVSRGRG		LLTPRARGVP
PTGYRPPPPP		PTQETYGEYD		YDDGYGTAYD		EQSYDSYDNS		YSTPAQSGAD
YYDYGHGLSE		ETYDSYGQEE		WTNSRHKAPS		ARTAKGVYRD		QPYGRY

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lee J.-S., Burr J.G. (1999). Salpalpha and Salpbeta, growth-arresting homologs of Sam68. Gene. 240: 133—147. PMID 10564820 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00421-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Di Fruscio M., Chen T., Richard S. (1999). Characterization of Sam68-like mammalian proteins SLM-1 and SLM-2: SLM-1 is a Src substrate during mitosis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 2710—2715. PMID 10077576 DOI:10.1073/pnas.96.6.2710
• Kool J., van Zaane W., van der Eb A.J., Terleth C. (2001). Down-regulation of T-STAR, a growth inhibitory protein, after SV40-mediated immortalization. Cell Growth Differ. 12: 535—541. PMID 11714634

Див. також

• Хромосома 8