Рецептор ламіну B

LBR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: C9JXK0 PDBe C9JXK0 RCSB Список кодів PDB 2DIG
Ідентифікатори
Символи	LBR, DHCR14B, LMN2R, PHA, TDRD18, lamin B receptor, PHASK, C14SR
Зовнішні ІД	OMIM: 600024 MGI: 2138281 HomoloGene: 2455 GeneCards: LBR
Пов'язані генетичні захворювання
Pelger-Huet anomaly, hydrops-ectopic calcification-moth-eaten skeletal dysplasia, regressive spondylometaphyseal dysplasia
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors • DNA binding • oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, NAD or NADP as acceptor • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromo shadow domain binding • lamin binding • delta14-sterol reductase activity • RNA binding • NADPH binding • oxidoreductase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of endoplasmic reticulum membrane • nuclear inner membrane • integral component of nuclear inner membrane • Ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • cholesterol biosynthetic process • sterol biosynthetic process • neutrophil differentiation • lipid metabolism • steroid biosynthetic process • steroid metabolic process • cholesterol metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3930	98386
Ensembl	ENSG00000143815	ENSMUSG00000004880
UniProt	Q14739	Q3U9G9
RefSeq (мРНК)	NM_002296 NM_194442	NM_133815
RefSeq (білок)	NP_002287 NP_919424	NP_598576
Локус (UCSC)	Хр. 1: 225.4 – 225.43 Mb	Хр. 1: 181.64 – 181.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LBR (англ. Lamin B receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 615 амінокислот, а молекулярна маса — 70 703.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSRKFADGE		VVRGRWPGSS		LYYEVEILSH		DSTSQLYTVK		YKDGTELELK
ENDIKPLTSF		RQRKGGSTSS		SPSRRRGSRS		RSRSRSPGRP		PKSARRSASA
SHQADIKEAR		REVEVKLTPL		ILKPFGNSIS		RYNGEPEHIE		RNDAPHKNTQ
EKFSLSQESS		YIATQYSLRP		RREEVKLKEI		DSKEEKYVAK		ELAVRTFEVT
PIRAKDLEFG		GVPGVFLIMF		GLPVFLFLLL		LMCKQKDPSL		LNFPPPLPAL
YELWETRVFG		VYLLWFLIQV		LFYLLPIGKV		VEGTPLIDGR		RLKYRLNGFY
AFILTSAVIG		TSLFQGVEFH		YVYSHFLQFA		LAATVFCVVL		SVYLYMRSLK
APRNDLSPAS		SGNAVYDFFI		GRELNPRIGT		FDLKYFCELR		PGLIGWVVIN
LVMLLAEMKI		QDRAVPSLAM		ILVNSFQLLY		VVDALWNEEA		LLTTMDIIHD
GFGFMLAFGD		LVWVPFIYSF		QAFYLVSHPN		EVSWPMASLI		IVLKLCGYVI
FRGANSQKNA		FRKNPSDPKL		AHLKTIHTST		GKNLLVSGWW		GFVRHPNYLG
DLIMALAWSL		PCGFNHILPY		FYIIYFTMLL		VHREARDEYH		CKKKYGVAWE
KYCQRVPYRI		FPYIY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR. J. Biol. Chem. 272: 14983—14989. PMID 9169472 DOI:10.1074/jbc.272.23.14983
• Papoutsopoulou S., Nikolakaki E., Giannakouros T. (1999). SRPK1 and LBR protein kinases show identical substrate specificities. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 602—607. PMID 10049757 DOI:10.1006/bbrc.1999.0249
• Duband-Goulet I., Courvalin J.-C. (2000). Inner nuclear membrane protein LBR preferentially interacts with DNA secondary structures and nucleosomal linker. Biochemistry. 39: 6483—6488. PMID 10828963 DOI:10.1021/bi992908b
• Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929—937. PMID 15882967 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.016
• Tseng L.C., Chen R.H. (2011). Temporal control of nuclear envelope assembly by phosphorylation of lamin B receptor. Mol. Biol. Cell. 22: 3306—3317. PMID 21795390 DOI:10.1091/mbc.E11-03-0199

Див. також

• Хромосома 1