LCN2

LCN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DFV, 1L6M, 1NGL, 1QQS, 1X71, 1X89, 1X8U, 3BY0, 3CBC, 3CMP, 3DSZ, 3DTQ, 3FW4, 3FW5, 3HWD, 3HWE, 3HWF, 3HWG, 3I0A, 3K3L, 3PEC, 3PED, 3T1D, 3TF6, 3TZS, 3U03, 3U0D, 4GH7, 4IAW, 4IAX, 4K19, 4MVI, 4MVK, 4MVL, 4QAE, 4ZFX, 4ZHC, 4ZHD, 4ZHF, 4ZHG, 4ZHH
Ідентифікатори
Символи	LCN2, 24p3, MSFI, NGAL, p25, lipocalin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600181 MGI: 96757 HomoloGene: 4064 GeneCards: LCN2
Онтологія гена Молекулярна функція • transporter activity • small molecule binding • protease binding • iron ion binding • protein homodimerization activity • enterobactin binding Клітинна компонента • екзосома • міжклітинний простір • гіалоплазма • specific granule lumen • extracellular region • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cytoplasmic vesicle lumen Біологічний процес • процес імунної системи • iron ion homeostasis • ion transport • вроджений імунітет • cellular iron ion homeostasis • GO:0097285 апоптоз • GO:0001306 response to oxidative stress • response to virus • response to bacterium • response to herbicide • response to mycotoxin • GO:1901313 positive regulation of gene expression • siderophore transport • antimicrobial humoral response • positive regulation of cell projection organization • response to nutrient levels • cellular response to nutrient levels • neutrophil degranulation • protein homotrimerization • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • GO:0015915 транспорт • cytokine-mediated signaling pathway • defense response to bacterium • sequestering of iron ion • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3934	16819
Ensembl	ENSG00000148346	ENSMUSG00000026822
UniProt	P80188	P11672
RefSeq (мРНК)	NM_005564	NM_008491
RefSeq (білок)	NP_005555	NP_032517
Локус (UCSC)	Хр. 9: 128.15 – 128.15 Mb	Хр. 2: 32.27 – 32.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LCN2 (англ. Lipocalin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 22 588.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLGLLWLGL		ALLGALHAQA		QDSTSDLIPA		PPLSKVPLQQ		NFQDNQFQGK
WYVVGLAGNA		ILREDKDPQK		MYATIYELKE		DKSYNVTSVL		FRKKKCDYWI
RTFVPGCQPG		EFTLGNIKSY		PGLTSYLVRV		VSTNYNQHAM		VFFKKVSQNR
EYFKITLYGR		TKELTSELKE		NFIRFSKSLG		LPENHIVFPV		PIDQCIDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, транспорт іонів, транспорт заліза, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном заліза. Секретований назовні.

Література

• Bundgaard J.R., Sengelov H., Borregaard N., Kjeldsen L. (1994). Molecular cloning and expression of a cDNA encoding NGAL: a lipocalin expressed in human neutrophils. Biochem. Biophys. Res. Commun. 202: 1468—1475. PMID 8060329 DOI:10.1006/bbrc.1994.2096
• Cowland J.B., Borregaard N. (1997). Molecular characterization and pattern of tissue expression of the gene for neutrophil gelatinase-associated lipocalin from humans. Genomics. 45: 17—23. PMID 9339356 DOI:10.1006/geno.1997.4896
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bartsch S., Tschesche H. (1995). Cloning and expression of human neutrophil lipocalin cDNA derived from bone marrow and ovarian cancer cells. FEBS Lett. 357: 255—259. PMID 7835423 DOI:10.1016/0014-5793(94)01303-I
• Triebel S., Blaeser J., Reinke H., Tschesche H. (1992). A 25 kDa alpha 2-microglobulin-related protein is a component of the 125 kDa form of human gelatinase. FEBS Lett. 314: 386—388. PMID 1281792 DOI:10.1016/0014-5793(92)81511-J
• Sheng Z., Wang S.Z., Green M.R. (2009). Transcription and signalling pathways involved in BCR-ABL-mediated misregulation of 24p3 and 24p3R. EMBO J. 28: 866—876. PMID 19229297 DOI:10.1038/emboj.2009.35

Див. також

• Хромосома 9