LFNG

LFNG
Ідентифікатори
Символи	LFNG, SCDO3, LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 602576 MGI: 1095413 HomoloGene: 22475 GeneCards: LFNG
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • glycosyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity • молекулярна функція • acetylglucosaminyltransferase activity Клітинна компонента • extracellular vesicle • integral component of membrane • integral component of Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • extracellular region Біологічний процес • somitogenesis • pattern specification process • regulation of somitogenesis • marginal zone B cell differentiation • negative regulation of Notch signaling pathway involved in somitogenesis • multicellular organism development • T cell differentiation • compartment pattern specification • animal organ morphogenesis • ovarian follicle development • positive regulation of protein binding • regulation of Notch signaling pathway • positive regulation of Notch signaling pathway • positive regulation of meiotic cell cycle • protein O-linked fucosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3955	16848
Ensembl	ENSG00000106003	ENSMUSG00000029570
UniProt	Q8NES3	O09010
RefSeq (мРНК)	NM_002304 NM_001040167 NM_001040168 NM_001166355	NM_008494
RefSeq (білок)	NP_001035257 NP_001035258 NP_001159827 NP_002295	NP_032520
Локус (UCSC)	Хр. 7: 2.51 – 2.53 Mb	Хр. 5: 140.59 – 140.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LFNG (англ. LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 41 773.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKRCGRRLL		LALAGALLAC		LLVLTADPPP		PPLPAERGRR		ALRSLAGPAG
AAPAPGLGAA		AAAPGALVRD		VHSLSEYFSL		LTRARRDAGP		PPGAAPRPAD
GHPRPLAEPL		APRDVFIAVK		TTKKFHRARL		DLLLETWISR		HKEMTFIFTD
GEDEALARHT		GNVVITNCSA		AHSRQALSCK		MAVEYDRFIE		SGRKWFCHVD
DDNYVNLRAL		LRLLASYPHT		RDVYVGKPSL		DRPIQAMERV		SENKVRPVHF
WFATGGAGFC		ISRGLALKMS		PWASGGHFMN		TAERIRLPDD		CTIGYIVEAL
LGVPLIRSGL		FHSHLENLQQ		VPTSELHEQV		TLSYGMFENK		RNAVHVKGPF
SVEADPSRFR		SIHCHLYPDT		PWCPRTAIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• Cole S.E., Levorse J.M., Tilghman S.M., Vogt T.F. (2002). Clock regulatory elements control cyclic expression of Lunatic fringe during somitogenesis. Dev. Cell. 3: 75—84. PMID 12110169 DOI:10.1016/S1534-5807(02)00212-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7