LHX2

LHX2
Ідентифікатори
Символи	LHX2, LH2, hLhx2, LIM homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603759 MGI: 96785 HomoloGene: 55848 GeneCards: LHX2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • chromatin binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • mesoderm development • telencephalon development • neural tube closure • retina development in camera-type eye • cerebral cortex development • transcription, DNA-templated • axon guidance • axon extension • hair follicle development • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • Нейрогенез • brain development • olfactory bulb development • нейробіологія розвитку • dorsal/ventral pattern formation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation • anatomical structure formation involved in morphogenesis • telencephalon regionalization • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression, epigenetic • negative regulation of neurogenesis • positive regulation of neural precursor cell proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9355	16870
Ensembl	ENSG00000106689	ENSMUSG00000000247
UniProt	P50458	Q9Z0S2
RefSeq (мРНК)	NM_004789	NM_001290646 NM_010710
RefSeq (білок)	NP_004780	NP_001277575 NP_034840
Локус (UCSC)	Хр. 9: 124 – 124.03 Mb	Хр. 2: 38.23 – 38.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LHX2 (англ. LIM homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 44 373.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLFHSLSGPE		VHGVIDEMDR		RAKSEAPAIS		SAIDRGDTET		TMPSISSDRA
ALCAGCGGKI		SDRYYLLAVD		KQWHMRCLKC		CECKLNLESE		LTCFSKDGSI
YCKEDYYRRF		SVQRCARCHL		GISASEMVMR		ARDLVYHLNC		FTCTTCNKML
TTGDHFGMKD		SLVYCRLHFE		ALLQGEYPAH		FNHADVAAAA		AAAAAAKSAG
LGAAGANPLG		LPYYNGVGTV		QKGRPRKRKS		PGPGADLAAY		NAALSCNEND
AEHLDRDQPY		PSSQKTKRMR		TSFKHHQLRT		MKSYFAINHN		PDAKDLKQLA
QKTGLTKRVL		QVWFQNARAK		FRRNLLRQEN		TGVDKSTDAA		LQTGTPSGPA
SELSNASLSP		SSTPTTLTDL		TSPTLPTVTS		VLTSVPGNLE		GHEPHSPSQT
TLTNLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9