MADCAM1

MADCAM1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BQS, 1GSM, 4HBQ, 4HC1, 4HCR, 4HD9
Ідентифікатори
Символи	MADCAM1, MACAM1, mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 102670 GeneCards: MADCAM1
Онтологія гена Молекулярна функція • integrin binding involved in cell-matrix adhesion Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана Біологічний процес • leukocyte tethering or rolling • heterotypic cell-cell adhesion • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • extracellular matrix organization • receptor clustering • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of immune response • positive regulation of leukocyte migration • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of lymphocyte migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8174	н/д
Ensembl	ENSG00000099866	н/д
UniProt	Q13477	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_130762 NM_130760	н/д
RefSeq (білок)	NP_570116 NP_570118	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 0.49 – 0.51 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

MADCAM1 (англ. Mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 40 155.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFGLALLLA		GLLGLLLGQS		LQVKPLQVEP		PEPVVAVALG		ASRQLTCRLA
CADRGASVQW		RGLDTSLGAV		QSDTGRSVLT		VRNASLSAAG		TRVCVGSCGG
RTFQHTVQLL		VYAFPDQLTV		SPAALVPGDP		EVACTAHKVT		PVDPNALSFS
LLVGGQELEG		AQALGPEVQE		EEEEPQGDED		VLFRVTERWR		LPPLGTPVPP
ALYCQATMRL		PGLELSHRQA		IPVLHSPTSP		EPPDTTSPES		PDTTSPESPD
TTSQEPPDTT		SPEPPDKTSP		EPAPQQGSTH		TPRSPGSTRT		RRPEISQAGP
TQGEVIPTGS		SKPAGDQLPA		ALWTSSAVLG		LLLLALPTYH		LWKRCRHLAE
DDTHPPASLR		LLPQVSAWAG		LRGTGQVGIS		PS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dando J., Wilkinson K.W., Ortlepp S., King D.J., Brady R.L. (2002). A reassessment of the MAdCAM-1 structure and its role in integrin recognition. Acta Crystallogr. D. 58: 233—241. PMID 11807247 DOI:10.1107/S0907444901020522
• Shyjan A.M., Bertagnolli M., Kenney C.J., Briskin M.J. (1996). Human mucosal addressin cell adhesion molecule-1 (MAdCAM-1) demonstrates structural and functional similarities to the alpha 4 beta 7-integrin binding domains of murine MAdCAM-1, but extreme divergence of mucin-like sequences. J. Immunol. 156: 2851—2857. PMID 8609404

Див. також

• Хромосома 19