MIB1

MIB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4TSE, 4XI6, 4XI7, 4XIB
Ідентифікатори
Символи	MIB1, DIP-1, DIP1, LVNC7, MIB, ZZANK2, ZZZ6, mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1, MIB E3 ubiquitin protein ligase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608677 MGI: 2443157 HomoloGene: 10810 GeneCards: MIB1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • Центр організації мікротрубочок • Цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • somitogenesis • ендоцитоз • negative regulation of neuron differentiation • in utero embryonic development • heart looping • positive regulation of endocytosis • heart development • blood vessel development • Убіквітин-залежний протеоліз • neural tube formation • Сигнальний шлях Notch Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57534	225164
Ensembl	ENSG00000101752	ENSMUSG00000024294
UniProt	Q86YT6	Q80SY4
RefSeq (мРНК)	NM_020774	NM_144860 NM_001364997
RefSeq (білок)	NP_065825	NP_659109 NP_001351926
Локус (UCSC)	Хр. 18: 21.7 – 21.87 Mb	Хр. 18: 10.73 – 10.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MIB1 (англ. Mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 110 136.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNSRNNRVM		VEGVGARVVR		GPDWKWGKQD		GGEGHVGTVR		SFESPEEVVV
VWDNGTAANY		RCSGAYDLRI		LDSAPTGIKH		DGTMCDTCRQ		QPIIGIRWKC
AECTNYDLCT		VCYHGDKHHL		RHRFYRITTP		GSERVLLESR		RKSKKITARG
IFAGARVVRG		VDWQWEDQDG		GNGRRGKVTE		IQDWSASSPH		SAAYVLWDNG
AKNLYRVGFE		GMSDLKCVQD		AKGGSFYRDH		CPVLGEQNGN		RNPGGLQIGD
LVNIDLDLEI		VQSLQHGHGG		WTDGMFETLT		TTGTVCGIDE		DHDIVVQYPS
GNRWTFNPAV		LTKANIVRSG		DAAQGAEGGT		SQFQVGDLVQ		VCYDLERIKL
LQRGHGEWAE		AMLPTLGKVG		RVQQIYSDSD		LKVEVCGTSW		TYNPAAVSKV
ASAGSAISNA		SGERLSQLLK		KLFETQESGD		LNEELVKAAA		NGDVAKVEDL
LKRPDVDVNG		QCAGHTAMQA		ASQNGHVDIL		KLLLKQNVDV		EAEDKDGDRA
VHHAAFGDEG		AVIEVLHRGS		ADLNARNKRR		QTPLHIAVNK		GHLQVVKTLL
DFGCHPSLQD		SEGDTPLHDA		ISKKRDDILA		VLLEAGADVT		ITNNNGFNAL
HHAALRGNPS		AMRVLLSKLP		RPWIVDEKKD		DGYTALHLAA		LNNHVEVAEL
LVHQGNANLD		IQNVNQQTAL		HLAVERQHTQ		IVRLLVRAGA		KLDIQDKDGD
TPLHEALRHH		TLSQLRQLQD		MQDVGKVDAA		WEPSKNTLIM		GLGTQGAEKK
SAASIACFLA		ANGADLSIRN		KKGQSPLDLC		PDPNLCKALA		KCHKEKVSGQ
VGSRSPSMIS		NDSETLEECM		VCSDMKRDTL		FGPCGHIATC		SLCSPRVKKC
LICKEQVQSR		TKIEECVVCS		DKKAAVLFQP		CGHMCACENC		ANLMKKCVQC
RAVVERRVPF		IMCCGGKSSE		DATDDISSGN		IPVLQKDKDN		TNVNADVQKL
QQQLQDIKEQ		TMCPVCLDRL		KNMIFLCGHG		TCQLCGDRMS		ECPICRKAIE
RRILLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Li S., Wang L., Berman M., Kong Y.Y., Dorf M.E. (2011). Mapping a dynamic innate immunity protein interaction network regulating type I interferon production. Immunity. 35: 426—440. PMID 21903422 DOI:10.1016/j.immuni.2011.06.014

Див. також

• Хромосома 18