MSR1

MSR1
Ідентифікатори
Символи	MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Зовнішні ІД	OMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scavenger receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • low-density lipoprotein particle binding; • amyloid-beta binding; • cargo receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • Колаген; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • low-density lipoprotein particle; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle;
Біологічний процес	• cholesterol transport; • plasma lipoprotein particle clearance; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • ендоцитоз; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • lipoprotein transport; • positive regulation of cholesterol storage; • phagocytosis, engulfment; • negative regulation of gene expression; • amyloid-beta clearance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4481
	20288
	ENSG00000038945
	ENSMUSG00000025044
	P21757
	P30204
	NM_138716; NM_002445; NM_138715; NM_001363744
	NM_001113326; NM_031195
	NP_002436; NP_619729; NP_619730; NP_001350673
	NP_001106797; NP_112472
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQWDHFHNQ	QEDTDSCSES	VKFDARSMTA	LLPPNPKNSP	SLQEKLKSFK
AALIALYLLV	FAVLIPLIGI	VAAQLLKWET	KNCSVSSTNA	NDITQSLTGK
GNDSEEEMRF	QEVFMEHMSN	MEKRIQHILD	MEANLMDTEH	FQNFSMTTDQ
RFNDILLQLS	TLFSSVQGHG	NAIDEISKSL	ISLNTTLLDL	QLNIENLNGK
IQENTFKQQE	EISKLEERVY	NVSAEIMAMK	EEQVHLEQEI	KGEVKVLNNI
TNDLRLKDWE	HSQTLRNITL	IQGPPGPPGE	KGDRGPTGES	GPRGFPGPIG
PPGLKGDRGA	IGFPGSRGLP	GYAGRPGNSG	PKGQKGEKGS	GNTLTPFTKV
RLVGGSGPHE	GRVEILHSGQ	WGTICDDRWE	VRVGQVVCRS	LGYPGVQAVH
KAAHFGQGTG	PIWLNEVFCF	GRESSIEECK	IRQWGTRACS	HSEDAGVTCT
L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Resnick D., Chatterton J.E., Schwartz K., Slayter H., Krieger M. (1996). Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain. J. Biol. Chem. 271: 26924—26930. PMID 8900177 DOI:10.1074/jbc.271.43.26924
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Gough P.J., Greaves D.R., Gordon S. (1998). A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake. J. Lipid Res. 39: 531—543. PMID 9548586