NAA40

NAA40
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4U9V, 4U9W
Ідентифікатори
Символи	NAA40, NAT11, PATT1, N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit, NatD, hNatD, N-alpha-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit
Зовнішні ІД	MGI: 1918249 HomoloGene: 41588 GeneCards: NAA40
Онтологія гена Молекулярна функція • acyltransferase activity • transferase activity • H4 histone acetyltransferase activity • H2A histone acetyltransferase activity • peptide-serine-N-acetyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • lipid metabolism • N-terminal protein amino acid acetylation • histone H4 acetylation • histone H2A acetylation • regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79829	70999
Ensembl	ENSG00000110583	ENSMUSG00000024764
UniProt	Q86UY6	Q8VE10
RefSeq (мРНК)	NM_001300800 NM_024771	NM_027643
RefSeq (білок)	NP_001287729 NP_079047	NP_081919
Локус (UCSC)	Хр. 11: 63.94 – 63.96 Mb	Хр. 19: 7.2 – 7.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NAA40 (англ. N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 27 194.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRKSSKAKE		KKQKRLEERA		AMDAVCAKVD		AANRLGDPLE		AFPVFKKYDR
NGLNVSIECK		RVSGLEPATV		DWAFDLTKTN		MQTMYEQSEW		GWKDREKREE
MTDDRAWYLI		AWENSSVPVA		FSHFRFDVEC		GDEVLYCYEV		QLESKVRRKG
LGKFLIQILQ		LMANSTQMKK		VMLTVFKHNH		GAYQFFREAL		QFEIDDSSPS
MSGCCGEDCS		YEILSRRTKF		GDSHHSHAGG		HCGGCCH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз, ліпопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Polevoda B., Arnesen T., Sherman F. (2009). A synopsis of eukaryotic Nalpha-terminal acetyltransferases: nomenclature, subunits and substrates. BMC Proc. 3: S2—S2. PMID 19660095 DOI:10.1186/1753-6561-3-S6-S2
• Pavlou D., Kirmizis A. (2016). Depletion of histone N-terminal-acetyltransferase Naa40 induces p53-independent apoptosis in colorectal cancer cells via the mitochondrial pathway. Apoptosis. 21: 298—311. PMID 26666750 DOI:10.1007/s10495-015-1207-0
• Jedrzejewski R.P., Kazmierkiewicz R. (2013). Structure of Patt1 human proapoptotic histone acetyltransferase. J. Mol. Model. 19: 5533—5538. PMID 24248912 DOI:10.1007/s00894-013-2043-1
• Magin R.S., Liszczak G.P., Marmorstein R. (2015). The molecular basis for histone H4- and H2A-specific amino-terminal acetylation by NatD. Structure. 23: 332—341. PMID 25619998 DOI:10.1016/j.str.2014.10.025

Див. також

• Хромосома 11