Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NR4A2
Ідентифікатори
Символи
NR4A2 , HZF-3, NOT, NURR1, RNR1, TINUR, nuclear receptor subfamily 4 group A member 2
Зовнішні ІД
OMIM : 601828 MGI: 1352456 HomoloGene: 4509 GeneCards: NR4A2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• retinoid X receptor binding • protein homodimerization activity • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • steroid hormone receptor activity • RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948 protein binding • glucocorticoid receptor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • protein heterodimerization activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Цитоплазма • клітинне ядро • nucleoplasm • nuclear speck • transcription regulator complex
Біологічний процес
• dopaminergic neuron differentiation • cellular response to oxidative stress • response to hypoxia • response to amphetamine • нейробіологія розвитку • neuron maturation • steroid hormone mediated signaling pathway • central nervous system projection neuron axonogenesis • regulation of transcription, DNA-templated • central nervous system neuron differentiation • negative regulation of apoptotic signaling pathway • cellular response to corticotropin-releasing hormone stimulus • positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of respiratory gaseous exchange • regulation of dopamine metabolic process • adult locomotory behavior • Регуляція експресії генів • habenula development • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • fat cell differentiation • post-embryonic development • dopamine biosynthetic process • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of neuron apoptotic process • canonical Wnt signaling pathway • general adaptation syndrome • neuron differentiation • Сигнальна трансдукція • dopamine metabolic process • transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • neuron migration • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • cellular response to extracellular stimulus • midbrain dopaminergic neuron differentiation • Експресія генів • transcription from RNA polymerase II promoter
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 156.32 – 156.34 Mb
Хр. 2: 57.11 – 57.12 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
NR4A2 (англ. Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 598 амінокислот , а молекулярна маса — 66 591[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPCVQAQYGS SPQGASPASQ SYSYHSSGEY SSDFLTPEFV KFSMDLTNTE
ITATTSLPSF STFMDNYSTG YDVKPPCLYQ MPLSGQQSSI KVEDIQMHNY
QQHSHLPPQS EEMMPHSGSV YYKPSSPPTP TTPGFQVQHS PMWDDPGSLH
NFHQNYVATT HMIEQRKTPV SRLSLFSFKQ SPPGTPVSSC QMRFDGPLHV
PMNPEPAGSH HVVDGQTFAV PNPIRKPASM GFPGLQIGHA SQLLDTQVPS
PPSRGSPSNE GLCAVCGDNA ACQHYGVRTC EGCKGFFKRT VQKNAKYVCL
ANKNCPVDKR RRNRCQYCRF QKCLAVGMVK EVVRTDSLKG RRGRLPSKPK
SPQEPSPPSP PVSLISALVR AHVDSNPAMT SLDYSRFQAN PDYQMSGDDT
QHIQQFYDLL TGSMEIIRGW AEKIPGFADL PKADQDLLFE SAFLELFVLR
LAYRSNPVEG KLIFCNGVVL HRLQCVRGFG EWIDSIVEFS SNLQNMNIDI
SAFSCIAALA MVTERHGLKE PKRVEELQNK IVNCLKDHVT FNNGGLNRPN
YLSKLLGKLP ELRTLCTQGL QRIFYLKLED LVPPPAIIDK LFLDTLPF
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Mages H.W., Rilke O., Bravo R., Senger G., Kroczek R.A. (1994). NOT, a human immediate-early response gene closely related to the steroid/thyroid hormone receptor NAK1/TR3.. Mol. Endocrinol. 8 : 1583 — 1591. PubMed DOI :10.1210/mend.8.11.7877627
Torii T., Kawarai T., Nakamura S., Kawakami H. (1999). Organization of the human orphan nuclear receptor Nurr1 gene.. Gene 230 : 225 — 232. PubMed DOI :10.1016/S0378-1119(99)00064-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14 : 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI :10.1101/gr.2596504
Messmer K., Remington M.P., Skidmore F., Fishman P.S. (2007). Induction of tyrosine hydroxylase expression by the transcription factor Pitx3.. Int. J. Dev. Neurosci. 25 : 29 — 37. PubMed DOI :10.1016/j.ijdevneu.2006.11.003
Garcia-Yague A.J., Rada P., Rojo A.I., Lastres-Becker I., Cuadrado A. (2013). Nuclear import and export signals control the subcellular localization of Nurr1 protein in response to oxidative stress.. J. Biol. Chem. 288 : 5506 — 5517. PubMed DOI :10.1074/jbc.M112.439190
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші