NTRK3

NTRK3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WWC, 3V5Q, 4YMJ
Ідентифікатори
Символи	NTRK3, GP145-TrkC, TRKC, gp145(trkC), neurotrophic receptor tyrosine kinase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 191316 MGI: 97385 HomoloGene: 49183 GeneCards: NTRK3
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Гоше
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein tyrosine kinase activity • neurotrophin binding • protein kinase activity • transferase activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • kinase activity • neurotrophin receptor activity • GPI-linked ephrin receptor activity • ATP binding • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • receptor complex • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • аксон Біологічний процес • циркадний ритм • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • ephrin receptor signaling pathway • response to ethanol • activation of protein kinase B activity • positive regulation of synapse assembly • multicellular organism development • positive regulation of actin cytoskeleton reorganization • positive regulation of cell migration • response to corticosterone • protein autophosphorylation • negative regulation of cell death • heart development • positive regulation of apoptotic process • peptidyl-tyrosine phosphorylation • cochlea development • нейробіологія розвитку • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • protein phosphorylation • neurotrophin signaling pathway • cellular response to retinoic acid • neuron fate specification • positive regulation of axon extension involved in regeneration • positive regulation of cell population proliferation • modulation by virus of host transcription • lens fiber cell differentiation • mechanoreceptor differentiation • response to axon injury • positive regulation of positive chemotaxis • диференціація клітин • negative regulation of astrocyte differentiation • positive regulation of protein phosphorylation • neuron migration • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of phospholipase C activity • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • regulation of postsynaptic density assembly • regulation of presynapse assembly • negative regulation of signal transduction • positive regulation of neuron projection development • neuronal action potential propagation • myelination in peripheral nervous system • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to nerve growth factor stimulus • regulation of MAPK cascade • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of neurotrophin TRK receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4916	18213
Ensembl	ENSG00000140538	ENSMUSG00000059146
UniProt	Q16288	Q6VNS1
RefSeq (мРНК)	NM_001007156 NM_001012338 NM_001243101 NM_002530 NM_001320134 NM_001320135 NM_001375810 NM_001375811 NM_001375812 NM_001375813 NM_001375814	NM_008746 NM_182809
RefSeq (білок)	NP_001007157 NP_001012338 NP_001230030 NP_001307063 NP_001307064 NP_002521 NP_001362739 NP_001362740 NP_001362741 NP_001362742 NP_001362743 NP_002521.2	NP_032772 NP_877961
Локус (UCSC)	Хр. 15: 87.86 – 88.26 Mb	Хр. 7: 78.18 – 78.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NTRK3 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 428.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVSLCPAKC		SFWRIFLLGS		VWLDYVGSVL		ACPANCVCSK		TEINCRRPDD
GNLFPLLEGQ		DSGNSNGNAS		INITDISRNI		TSIHIENWRS		LHTLNAVDME
LYTGLQKLTI		KNSGLRSIQP		RAFAKNPHLR		YINLSSNRLT		TLSWQLFQTL
SLRELQLEQN		FFNCSCDIRW		MQLWQEQGEA		KLNSQNLYCI		NADGSQLPLF
RMNISQCDLP		EISVSHVNLT		VREGDNAVIT		CNGSGSPLPD		VDWIVTGLQS
INTHQTNLNW		TNVHAINLTL		VNVTSEDNGF		TLTCIAENVV		GMSNASVALT
VYYPPRVVSL		EEPELRLEHC		IEFVVRGNPP		PTLHWLHNGQ		PLRESKIIHV
EYYQEGEISE		GCLLFNKPTH		YNNGNYTLIA		KNPLGTANQT		INGHFLKEPF
PESTDNFILF		DEVSPTPPIT		VTHKPEEDTF		GVSIAVGLAA		FACVLLVVLF
VMINKYGRRS		KFGMKGPVAV		ISGEEDSASP		LHHINHGITT		PSSLDAGPDT
VVIGMTRIPV		IENPQYFRQG		HNCHKPDTYV		QHIKRRDIVL		KRELGEGAFG
KVFLAECYNL		SPTKDKMLVA		VKALKDPTLA		ARKDFQREAE		LLTNLQHEHI
VKFYGVCGDG		DPLIMVFEYM		KHGDLNKFLR		AHGPDAMILV		DGQPRQAKGE
LGLSQMLHIA		SQIASGMVYL		ASQHFVHRDL		ATRNCLVGAN		LLVKIGDFGM
SRDVYSTDYY		RLFNPSGNDF		CIWCEVGGHT		MLPIRWMPPE		SIMYRKFTTE
SDVWSFGVIL		WEIFTYGKQP		WFQLSNTEVI		ECITQGRVLE		RPRVCPKEVY
DVMLGCWQRE		PQQRLNIKEI		YKILHALGKA		TPIYLDILG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

• McGregor L.M., Baylin S.B., Griffin C.A., Hawkins A.L., Nelkin B.D. (1994). Molecular cloning of the cDNA for human TrkC (NTRK3), chromosomal assignment, and evidence for a splice variant. Genomics. 22: 267—272. PMID 7806211 DOI:10.1006/geno.1994.1383
• Ichaso N., Rodriguez R.E., Martin-Zanca D., Gonzalez-Sarmiento R. (1998). Genomic characterization of the human trkC gene. Oncogene. 17: 1871—1875. PMID 9778053 DOI:10.1038/sj.onc.1202100

Див. також

• Хромосома 15