NUB1

NUB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WJU
Ідентифікатори
Символи	NUB1, BS4, NUB1L, NYREN18, negative regulator of ubiquitin-like proteins 1, negative regulator of ubiquitin like proteins 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607981 MGI: 1889001 HomoloGene: 41108 GeneCards: NUB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • гіалоплазма • ядерце Біологічний процес • response to tumor necrosis factor • response to interferon-gamma • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51667	53312
Ensembl	ENSG00000013374	ENSMUSG00000028954
UniProt	Q9Y5A7	P54729
RefSeq (мРНК)	NM_001243351 NM_016118 NM_001363529 NM_001385353 NM_001385354 NM_001385355 NM_001385356 NM_001385361	NM_016736 NM_001305264
RefSeq (білок)	NP_001230280 NP_057202 NP_001350458	NP_001292193 NP_058016
Локус (UCSC)	Хр. 7: 151.34 – 151.38 Mb	Хр. 5: 24.89 – 24.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUB1 (англ. Negative regulator of ubiquitin like proteins 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 615 амінокислот, а молекулярна маса — 70 538.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQKKYLQAK		LTQFLREDRI		QLWKPPYTDE		NKKVGLALKD		LAKQYSDRLE
CCENEVEKVI		EEIRCKAIER		GTGNDNYRTT		GIATIEVFLP		PRLKKDRKNL
LETRLHITGR		ELRSKIAETF		GLQENYIKIV		INKKQLQLGK		TLEEQGVAHN
VKAMVLELKQ		SEEDARKNFQ		LEEEEQNEAK		LKEKQIQRTK		RGLEILAKRA
AETVVDPEMT		PYLDIANQTG		RSIRIPPSER		KALMLAMGYH		EKGRAFLKRK
EYGIALPCLL		DADKYFCECC		RELLDTVDNY		AVLQLDIVWC		YFRLEQLECL
DDAEKKLNLA		QKCFKNCYGE		NHQRLVHIKG		NCGKEKVLFL		RLYLLQGIRN
YHSGNDVEAY		EYLNKARQLF		KELYIDPSKV		DNLLQLGFTA		QEARLGLRAC
DGNVDHAATH		ITNRREELAQ		IRKEEKEKKR		RRLENIRFLK		GMGYSTHAAQ
QVLHAASGNL		DEALKILLSN		PQMWWLNDSN		PETDNRQESP		SQENIDRLVY
MGFDALVAEA		ALRVFRGNVQ		LAAQTLAHNG		GSLPPELPLS		PEDSLSPPAT
SPSDSAGTSS		ASTDEDMETE		AVNEILEDIP		EHEEDYLDST		LEDEEIIIAE
YLSYVENRKS		ATKKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Kito K., Yeh E.T.H., Kamitani T. (2001). NUB1, a NEDD8-interacting protein, is induced by interferon and down-regulates the NEDD8 expression. J. Biol. Chem. 276: 20603—20609. PMID 11259415 DOI:10.1074/jbc.M100920200
• Tanaka T., Kawashima H., Yeh E.T.H., Kamitani T. (2003). Regulation of the NEDD8 conjugation system by a splicing variant, NUB1L. J. Biol. Chem. 278: 32905—32913. PMID 12816948 DOI:10.1074/jbc.M212057200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kamitani T., Kito K., Fukuda-Kamitani T., Yeh E.T.H. (2001). Targeting of NEDD8 and its conjugates for proteasomal degradation by NUB1. J. Biol. Chem. 276: 46655—46660. PMID 11585840 DOI:10.1074/jbc.M108636200
• Hipp M.S., Raasi S., Groettrup M., Schmidtke G. (2004). NEDD8 ultimate buster-1L interacts with the ubiquitin-like protein FAT10 and accelerates its degradation. J. Biol. Chem. 279: 16503—16510. PMID 14757770 DOI:10.1074/jbc.M310114200

Див. також

• Хромосома 7