OLFM1

OLFM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4XAT
Ідентифікатори
Символи	OLFM1, AMY, NOE1, NOELIN1, OlfA, olfactomedin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605366 MGI: 1860437 HomoloGene: 8612 GeneCards: OLFM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • Міжклітинні контакти • аксон • neuronal cell body • перикаріон • axonal growth cone • синапс • cell projection • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір Біологічний процес • multicellular organism development • atrioventricular valve formation • neuronal signal transduction • GO:1901313 positive regulation of gene expression • regulation of axon extension • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • negative regulation of gene expression • нейробіологія розвитку • cardiac epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10439	56177
Ensembl	ENSG00000130558	ENSMUSG00000026833
UniProt	Q99784	O88998
RefSeq (мРНК)	NM_058199 NM_001282611 NM_001282612 NM_006334 NM_014279	NM_001038612 NM_001038613 NM_001038614 NM_019498
RefSeq (білок)	NP_001269540 NP_001269541 NP_006325 NP_055094	NP_001033701 NP_001033702 NP_001033703 NP_062371
Локус (UCSC)	Хр. 9: 135.08 – 135.12 Mb	Хр. 2: 28.08 – 28.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OLFM1 (англ. Olfactomedin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 55 343.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVPLLKIGV		VLSTMAMITN		WMSQTLPSLV		GLNTTKLSAA		GGGTLDRSTG
VLPTNPEESW		QVYSSAQDSE		GRCICTVVAP		QQTMCSRDAR		TKQLRQLLEK
VQNMSQSIEV		LDRRTQRDLQ		YVEKMENQMK		GLESKFKQVE		ESHKQHLARQ
FKAIKAKMDE		LRPLIPVLEE		YKADAKLVLQ		FKEEVQNLTS		VLNELQEEIG
AYDYDELQSR		VSNLEERLRA		CMQKLACGKL		TGISDPVTVK		TSGSRFGSWM
TDPLAPEGDN		RVWYMDGYHN		NRFVREYKSM		VDFMNTDNFT		SHRLPHPWSG
TGQVVYNGSI		YFNKFQSHII		IRFDLKTETI		LKTRSLDYAG		YNNMYHYAWG
GHSDIDLMVD		ESGLWAVYAT		NQNAGNIVVS		RLDPVSLQTL		QTWNTSYPKR
SAGEAFIICG		TLYVTNGYSG		GTKVHYAYQT		NASTYEYIDI		PFQNKYSHIS
MLDYNPKDRA		LYAWNNGHQI		LYNVTLFHVI		RSDEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, синапсах. Також секретований назовні.

Література

• Yokoyama M., Nishi Y., Yoshii J., Okubo K., Matsubara K. (1996). Identification and cloning of neuroblastoma-specific and nerve tissue-specific genes through compiled expression profiles. DNA Res. 3: 311—320. PMID 9039501 DOI:10.1093/dnares/3.5.311
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sultana A., Nakaya N., Senatorov V.V., Tomarev S.I. (2011). Olfactomedin 2: expression in the eye and interaction with other olfactomedin domain-containing proteins. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 52: 2584—2592. PMID 21228389 DOI:10.1167/iovs.10-6356
• Mukhopadhyay A., Talukdar S., Bhattacharjee A., Ray K. (2004). Bioinformatic approaches for identification and characterization of olfactomedin related genes with a potential role in pathogenesis of ocular disorders. Mol. Vis. 10: 304—314. PMID 15123989

Див. також

• Хромосома 9