OTUB2

OTUB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TFF, 4FJV
Ідентифікатори
Символи	OTUB2, C14orf137, OTB2, OTU2, OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608338 MGI: 1915399 HomoloGene: 57056 GeneCards: OTUB2
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • NEDD8-specific protease activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • protein deubiquitination • protein K63-linked deubiquitination • protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • protein K11-linked deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	78990	68149
Ensembl	ENSG00000089723 ENSG00000277276	ENSMUSG00000021203
UniProt	Q96DC9	Q9CQX0
RefSeq (мРНК)	NM_023112	NM_001177841 NM_026580
RefSeq (білок)	NP_075601	NP_001171312 NP_080856
Локус (UCSC)	Хр. 14: 94.03 – 94.05 Mb	Хр. 12: 103.35 – 103.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUB2 (англ. OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 27 213.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSETSFNLIS		EKCDILSILR		DHPENRIYRR		KIEELSKRFT		AIRKTKGDGN
CFYRALGYSY		LESLLGKSRE		IFKFKERVLQ		TPNDLLAAGF		EEHKFRNFFN
AFYSVVELVE		KDGSVSSLLK		VFNDQSASDH		IVQFLRLLTS		AFIRNRADFF
RHFIDEEMDI		KDFCTHEVEP		MATECDHIQI		TALSQALSIA		LQVEYVDEMD
TALNHHVFPE		AATPSVYLLY		KTSHYNILYA		ADKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

• Balakirev M.Y., Tcherniuk S.O., Jaquinod M., Chroboczek J. (2003). Otubains: a new family of cysteine proteases in the ubiquitin pathway. EMBO Rep. 4: 517—522. PMID 12704427 DOI:10.1038/sj.embor.embor824
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14