PAN2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PAN2
Ідентифікатори
Символи PAN2, USP52, PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit, poly(A) specific ribonuclease subunit PAN2
Зовнішні ІД OMIM: 617447 MGI: 1918984 HomoloGene: 5918 GeneCards: PAN2
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_014871
NM_001127460
NM_001166279
NM_001252326
NM_001252327
NM_133992
NM_001358822
RefSeq (білок)
NP_001120932
NP_001159751
NP_055686
NP_001239255
NP_001239256
NP_598753
NP_001345751
Локус (UCSC) Хр. 12: 56.32 – 56.33 Mb Хр. 10: 128.14 – 128.16 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PAN2 (англ. PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 202 амінокислот, а молекулярна маса — 135 368[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNFEGLDPGLAEYAPAMHSALDPVLDAHLNPSLLQNVELDPEGVALEALP
VQESVHIMEGVYSELHSVVAEVGVPVSVSHFDLHEEMLWVGSHGGHATSF
FGPALERYSSFQVNGSDDIRQIQSLENGILFLTKNNLKYMARGGLIIFDY
LLDENEDMHSLLLTDSSTLLVGGLQNHIIEIDLNTVQETQKYAVETPGVT
IMRQTNRFFFCGHTSGKVSLRDLRTFKVEHEFDAFSGSLSDFDVHGNLLA
ACGFSSRLTGLACDRFLKVYDLRMMRAITPLQVHVDPAFLRFIPTYTSRL
AIISQSGQCQFCEPTGLANPADIFHVNPVGPLLMTFDVSASKQALAFGDS
EGCVHLWTDSPEPSFNPYSRETEFALPCLVDSLPPLDWSQDLLPLSLIPV
PLTTDTLLSDWPAANSAPAPRRAPPVDAEILRTMKKVGFIGYAPNPRTRL
RNQIPYRLKESDSEFDSFSQVTESPVGREEEPHLHMVSKKYRKVTIKYSK
LGLEDFDFKHYNKTLFAGLEPHIPNAYCNCMIQVLYFLEPVRCLIQNHLC
QKEFCLACELGFLFHMLDLSRGDPCQGNNFLRAFRTIPEASALGLILADS
DEASGKGNLARLIQRWNRFILTQLHQDMQELEIPQAYRGAGGSSFCSSGD
SVIGQLFSCEMENCSLCRCGSETVRASSTLLFTLSYPDGSKSDKTGKNYD
FAQVLKRSICLDQNTQAWCDTCEKYQPTIQTRNIRHLPDILVINCEVNSS
KEADFWRMQAEVAFKMAVKKHGGEISKNKEFALADWKELGSPEGVLVCPS
IEELKNVWLPFSIRMKMTKNKGLDVCNWTDGDEMQWGPARAEEEHGVYVY
DLMATVVHILDSRTGGSLVAHIKVGETYHQRKEGVTHQQWYLFNDFLIEP
IDKHEAVQFDMNWKVPAILYYVKRNLNSRYNLNIKNPIEASVLLAEASLA
RKQRKTHTTFIPLMLNEMPQIGDLVGLDAEFVTLNEEEAELRSDGTKSTI
KPSQMSVARITCVRGQGPNEGIPFIDDYISTQEQVVDYLTQYSGIKPGDL
DAKISSKHLTTLKSTYLKLRFLIDIGVKFVGHGLQKDFRVINLMVPKDQV
LDTVYLFHMPRKRMISLRFLAWYFLDLKIQGETHDSIEDARTALQLYRKY
LELSKNGTEPESFHKVLKGLYEKGRKMDWKVPEPEGQTSPKNAAVFSSVL
AL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література[ред. | ред. код]

  • Uchida N., Hoshino S., Katada T. (2004). Identification of a human cytoplasmic poly(A) nuclease complex stimulated by poly(A)-binding protein.. J. Biol. Chem. 279: 1383 — 1391.  PMID 14583602 DOI:10.1074/jbc.M309125200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292.  PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Christie M., Boland A., Huntzinger E., Weichenrieder O., Izaurralde E. (2013). Structure of the PAN3 pseudokinase reveals the basis for interactions with the PAN2 deadenylase and the GW182 proteins.. Mol. Cell. 51: 360 — 373.  PMID 23932717 DOI:10.1016/j.molcel.2013.07.011

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:. 
  2. Mouse PubMed Reference:. 
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20074 (англ.). Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. 
  4. UniProt, Q504Q3 (англ.). Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. 

Див. також[ред. | ред. код]