PCDH1

PCDH1
Ідентифікатори
Символи	PCDH1, PC42, PCDH42, protocadherin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603626 MGI: 104692 HomoloGene: 12613 GeneCards: PCDH1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • cell-cell junction • клітинне ядро • ядерце • Міжклітинні контакти • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • cell-cell signaling • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5097	75599
Ensembl	ENSG00000156453	ENSMUSG00000051375
UniProt	Q08174	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001278613 NM_001278615 NM_002587 NM_032420	NM_029357
RefSeq (білок)	NP_001265542 NP_001265544 NP_002578 NP_115796	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.85 – 141.88 Mb	Хр. 18: 38.32 – 38.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH1 (англ. Protocadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 114 743.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSGAGGRRC		PEAALLILGP		PRMEHLRHSP		GPGGQRLLLP		SMLLALLLLL
APSPGHATRV		VYKVPEEQPP		NTLIGSLAAD		YGFPDVGHLY		KLEVGAPYLR
VDGKTGDIFT		TETSIDREGL		RECQNQLPGD		PCILEFEVSI		TDLVQNGSPR
LLEGQIEVQD		INDNTPNFAS		PVITLAIPEN		TNIGSLFPIP		LASDRDAGPN
GVASYELQAG		PEAQELFGLQ		VAEDQEEKQP		QLIVMGNLDR		ERWDSYDLTI
KVQDGGSPPR		ASSALLRVTV		LDTNDNAPKF		ERPSYEAELS		ENSPIGHSVI
QVKANDSDQG		ANAEIEYTFH		QAPEVVRRLL		RLDRNTGLIT		VQGPVDREDL
STLRFSVLAK		DRGTNPKSAR		AQVVVTVKDM		NDNAPTIEIR		GIGLVTHQDG
MANISEDVAE		ETAVALVQVS		DRDEGENAAV		TCVVAGDVPF		QLRQASETGS
DSKKKYFLQT		TTPLDYEKVK		DYTIEIVAVD		SGNPPLSSTN		SLKVQVVDVN
DNAPVFTQSV		TEVAFPENNK		PGEVIAEITA		SDADSGSNAE		LVYSLEPEPA
AKGLFTISPE		TGEIQVKTSL		DREQRESYEL		KVVAADRGSP		SLQGTATVLV
NVLDCNDNDP		KFMLSGYNFS		VMENMPALSP		VGMVTVIDGD		KGENAQVQLS
VEQDNGDFVI		QNGTGTILSS		LSFDREQQST		YTFQLKAVDG		GVPPRSAYVG
VTINVLDEND		NAPYITAPSN		TSHKLLTPQT		RLGETVSQVA		AEDFDSGVNA
ELIYSIAGGN		PYGLFQIGSH		SGAITLEKEI		ERRHHGLHRL		VVKVSDRGKP
PRYGTALVHL		YVNETLANRT		LLETLLGHSL		DTPLDIDIAG		DPEYERSKQR
GNILFGVVAG		VVAVALLIAL		AVLVRYCRQR		EAKSGYQAGK		KETKDLYAPK
PSGKASKGNK		SKGKKSKSPK		PVKPVEDEDE		AGLQKSLKFN		LMSDAPGDSP
RIHLPLNYPP		GSPDLGRHYR		SNSPLPSIQL		QPQSPSASKK		HQVVQDLPPA
NTFVGTGDTT		STGSEQYSDY		SYRTNPPKYP		SKQVGQPFQL		STPQPLPHPY
HGAIWTEVWE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5