PCDHA5

PCDHA5
Ідентифікатори
Символи	PCDHA5, CNR6, CNRN6, CNRS6, CRNR6, PCDH-ALPHA5, protocadherin alpha 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606311 MGI: 1298371 HomoloGene: 49565 GeneCards: PCDHA5
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56143	12941
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000103092
UniProt	Q9Y5H7	Q91Y15
RefSeq (мРНК)	NM_031501 NM_018908	NM_009959
RefSeq (білок)	NP_061731 NP_113689	NP_034089
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 18: 37.09 – 37.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHA5 (англ. Protocadherin alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 936 амінокислот, а молекулярна маса — 102 048.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVYSRRGSLG		SRLLLLWLLL		AYWKAGSGQL		HYSIPEEAKH		GTFVGRIAQD
LGLELAELVP		RLFRVASKGR		GDLLEVNLQN		GILFVNSRID		REELCRRRAE
CSIHLEVIVD		RPLQVFHVEV		AVKDINDNPP		RFSRQEQRLF		ILESRMPDSR
FPLEGASDLD		IGANAQLRYR		LNPNEYFDLD		VKTNEEETNF		LELVLRKSLD
REETQEHRLL		VIATDGGKPE		LTGTVQLLIN		VLDANDNAPE		FDKSIYNVRL
LENAPSGTLV		IKLNASDADE		GINKEIVYFF		SNLVLDDVKS		KFIINSNTGE
IKVNGELDYE		DYNSYEINID		AMDKSTFPLS		GHCKVVVKLL		DVNDNTPEMA
ITTLFLPVKE		DAPLSTVIAL		ISVSDRDSGA		NGQVTCSLMP		HVPFKLVSTF
KNYYSLVLDS		ALDRESVSVY		ELVVTARDGG		SPSLWATASV		SVEVADVNDN
APAFAQPQYT		VFVKENNPPG		CHIFTVSARD		ADAQENALVS		YSLVERRVGE
RPLSSYVSVH		AESGKVYALQ		PLDHEEVELL		QFQVSARDAG		VPPLGSNVTL
QVFVLDENDN		APALLVPRVG		GTGGAVSELV		PRSVGAGHVV		AKVRAVDPDS
GYNAWLSYEL		QPAPGSARIP		FRVGLYTGEI		STTRSLDETE		APRHRLLVLV
KDHGEPPLTA		TATVLVSLVE		SGQAPKASSR		ASAGAVGPEA		ALVDVNVYLI
IAICAVSSLL		VLTLLLYTAL		RCSAQPTEAV		CTRGKPTLLC		SSAVGSWSYS
QQRRQRVCSG		EAPPKTDLMA		FSPSLPQGPT		STDNPRQPNP		DWRYSASLRA
GMHSSVHLEE		AGILRAGPGG		PDQQWPTVSS		ATPEPEAGEV		SPPVGAGVNS
NSWTFKYGPG		NPKQSGPGEL		PDKFIIPGSP		AIISIRQEPT		NSQIDKSDFI
TFGKKEETKK		KKKKKKGNKT		QEKKEKGNST		TDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5