PDE4D

PDE4D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MKD, 1OYN, 1PTW, 1Q9M, 1TB7, 1TBB, 1XOM, 1XON, 1XOQ, 1XOR, 1Y2B, 1Y2C, 1Y2D, 1Y2E, 1Y2K, 1ZKN, 2FM0, 2FM5, 2PW3, 2QYN, 3G4G, 3G4I, 3G4K, 3G4L, 3G58, 3IAD, 3IAK, 3K4S, 3SL3, 3SL4, 3SL5, 3SL6, 3SL8, 3V9B, 4OGB, 4W1O, 4WCU
Ідентифікатори
Символи	PDE4D, ACRDYS2, DPDE3, HSPDE43, PDE4DN2, STRK1, phosphodiesterase 4D
Зовнішні ІД	OMIM: 600129 HomoloGene: 129755 GeneCards: PDE4D
Пов'язані генетичні захворювання
	рак молочної залози, ожиріння, натуральна віспа, рак стравоходу, бронхіальна астма
Реагує на сполуку
	Роліпрам
	dyphylline
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATPase binding; • scaffold protein binding; • cAMP binding; • зв'язування з іоном металу; • beta-2 adrenergic receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphoric diester hydrolase activity; • enzyme binding; • hydrolase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • transmembrane transporter binding; • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity; • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • центросома; • Центр організації мікротрубочок; • apical plasma membrane; • Цитоскелет; • мембрана; • Кальцієві канали; • voltage-gated calcium channel complex; • клітинна мембрана; • Ядерна мембрана;
Біологічний процес	• establishment of endothelial barrier; • smooth muscle contraction; • positive regulation of interleukin-5 production; • multicellular organism growth; • GO:0010260 старіння людини; • regulation of signaling receptor activity; • positive regulation of interferon-gamma production; • neutrophil chemotaxis; • positive regulation of interleukin-2 production; • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction; • adrenergic receptor signaling pathway; • cellular response to lipopolysaccharide; • T cell receptor signaling pathway; • adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in positive regulation of heart rate; • cAMP-mediated signaling; • cellular response to cAMP; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • leukocyte migration; • negative regulation of relaxation of cardiac muscle; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum; • negative regulation of heart contraction; • регуляція серцевого ритму; • regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity; • cAMP catabolic process; • cellular response to epinephrine stimulus; • regulation of cardiac muscle cell contraction; • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • negative regulation of cAMP-mediated signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5144
	24627
	ENSG00000113448
	ENSRNOG00000042536
	Q08499
	P14270
NM_001104631; NM_001165899; NM_001197218; NM_001197219; NM_001197220;
	NM_001197221; NM_001197222; NM_001197223; NM_006203; NM_001349241; NM_001349242; NM_001349243; NM_001364599; NM_001364600; NM_001364601; NM_001364602; NM_001364603; NM_001364604
	NM_001113328; NM_001113329; NM_001113332; NM_001113334; NM_017032
NP_001098101; NP_001159371; NP_001184147; NP_001184148; NP_001184149;
	NP_001184150; NP_001184151; NP_001184152; NP_006194; NP_001336170; NP_001336171; NP_001336172; NP_001351528; NP_001351529; NP_001351530; NP_001351531; NP_001351532; NP_001351533
	NP_001106799; NP_001106800; NP_001106803; NP_001106805; NP_058728
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDE4D (англ. Phosphodiesterase 4D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 809 амінокислот, а молекулярна маса — 91 115^[7].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAEGSSAPA	RAGSGEGSDS	AGGATLKAPK	HLWRHEQHHQ	YPLRQPQFRL
LHPHHHLPPP	PPPSPQPQPQ	CPLQPPPPPP	LPPPPPPPGA	ARGRYASSGA
TGRVRHRGYS	DTERYLYCRA	MDRTSYAVET	GHRPGLKKSR	MSWPSSFQGL
RRFDVDNGTS	AGRSPLDPMT	SPGSGLILQA	NFVHSQRRES	FLYRSDSDYD
LSPKSMSRNS	SIASDIHGDD	LIVTPFAQVL	ASLRTVRNNF	AALTNLQDRA
PSKRSPMCNQ	PSINKATITE	EAYQKLASET	LEELDWCLDQ	LETLQTRHSV
SEMASNKFKR	MLNRELTHLS	EMSRSGNQVS	EFISNTFLDK	QHEVEIPSPT
QKEKEKKKRP	MSQISGVKKL	MHSSSLTNSS	IPRFGVKTEQ	EDVLAKELED
VNKWGLHVFR	IAELSGNRPL	TVIMHTIFQE	RDLLKTFKIP	VDTLITYLMT
LEDHYHADVA	YHNNIHAADV	VQSTHVLLST	PALEAVFTDL	EILAAIFASA
IHDVDHPGVS	NQFLINTNSE	LALMYNDSSV	LENHHLAVGF	KLLQEENCDI
FQNLTKKQRQ	SLRKMVIDIV	LATDMSKHMN	LLADLKTMVE	TKKVTSSGVL
LLDNYSDRIQ	VLQNMVHCAD	LSNPTKPLQL	YRQWTDRIME	EFFRQGDRER
ERGMEISPMC	DKHNASVEKS	QVGFIDYIVH	PLWETWADLV	HPDAQDILDT
LEDNREWYQS	TIPQSPSPAP	DDPEEGRQGQ	TEKFQFELTL	EEDGESDTEK
DSGSQVEEDT	SCSDSKTLCT	QDSESTEIPL	DEQVEEEAVG	EEEESQPEAC
VIDDRSPDT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Nemoz G., Zhang R.B., Sette C., Conti M. (1996). Identification of cyclic AMP-phosphodiesterase variants from the PDE4D gene expressed in human peripheral mononuclear cells. FEBS Lett. 384: 97—102. PMID 8797812 DOI:10.1016/0014-5793(96)00300-6
Baecker P.A., Obernolte R., Bach C., Yee C., Shelton E.R. (1994). Isolation of a cDNA encoding a human rolipram-sensitive cyclic AMP phosphodiesterase (PDE IVD). Gene. 138: 253—256. PMID 8125310 DOI:10.1016/0378-1119(94)90818-4
Miro X., Casacuberta J.M., Gutierrez-Lopez M.D., Landazuri M.O., Puigdomenech P. (2000). Phosphodiesterases 4D and 7A splice variants in the response of HUVEC cells to TNF-alpha1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 415—421. PMID 10913353 DOI:10.1006/bbrc.2000.3146
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Richter W., Conti M. (2004). The oligomerization state determines regulatory properties and inhibitor sensitivity of type 4 cAMP-specific phosphodiesterases. J. Biol. Chem. 279: 30338—30348. PMID 15131123 DOI:10.1074/jbc.M312687200
Rosand J., Bayley N., Rost N., de Bakker P.I.W. (2006). Many hypotheses but no replication for the association between PDE4D and stroke. Nat. Genet. 38: 1091—1092. PMID 17006457 DOI:10.1038/ng1006-1091

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PDE4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8783 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q08499 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PDE4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Сполуки, які фізично взаємодіють з cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[4] Human PubMed Reference:.

[5] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-6] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8783 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-7] UniProt, Q08499 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

PDE4D

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук