PKN1

PKN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CXZ, 1URF, 2RMK, 4NKG, 4OTD, 4OTG, 4OTH, 4OTI
Ідентифікатори
Символи	PKN1, DBK, PAK-1, PAK1, PKN, PKN-ALPHA, PRK1, PRKCL1, Protein kinase N1
Зовнішні ІД	OMIM: 601032 MGI: 108022 HomoloGene: 48130 GeneCards: PKN1
Реагує на сполуку
staurosporine
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • protein kinase C activity • GO:0031493 histone binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • histone kinase activity (H3-T11 specific) • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • ATP binding • protein kinase C binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • Нуклеоплазма • midbody • Борозна розщеплення • клітинне ядро • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of germinal center formation • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • renal system process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • B cell apoptotic process • negative regulation of protein kinase activity • фосфорилювання • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • B cell homeostasis • spleen development • hyperosmotic response • transcription, DNA-templated • regulation of cell motility • protein phosphorylation • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • epithelial cell migration • negative regulation of B cell proliferation • regulation of immunoglobulin production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0007243 intracellular signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5585	320795
Ensembl	ENSG00000123143	ENSMUSG00000057672
UniProt	Q16512	P70268
RefSeq (мРНК)	NM_002741 NM_213560	NM_001199593 NM_177262
RefSeq (білок)	NP_002732 NP_998725	NP_001186522 NP_796236
Локус (UCSC)	Хр. 19: 14.43 – 14.47 Mb	Хр. 8: 84.39 – 84.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PKN1 (англ. Protein kinase N1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 942 амінокислот, а молекулярна маса — 103 932.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASDAVQSEP		RSWSLLEQLG		LAGADLAAPG		VQQQLELERE		RLRREIRKEL
KLKEGAENLR		RATTDLGRSL		GPVELLLRGS		SRRLDLLHQQ		LQELHAHVVL
PDPAATHDGP		QSPGAGGPTC		SATNLSRVAG		LEKQLAIELK		VKQGAENMIQ
TYSNGSTKDR		KLLLTAQQML		QDSKTKIDII		RMQLRRALQA		GQLENQAAPD
DTQGSPDLGA		VELRIEELRH		HFRVEHAVAE		GAKNVLRLLS		AAKAPDRKAV
SEAQEKLTES		NQKLGLLREA		LERRLGELPA		DHPKGRLLRE		ELAAASSAAF
STRLAGPFPA		THYSTLCKPA		PLTGTLEVRV		VGCRDLPETI		PWNPTPSMGG
PGTPDSRPPF		LSRPARGLYS		RSGSLSGRSS		LKAEAENTSE		VSTVLKLDNT
VVGQTSWKPC		GPNAWDQSFT		LELERARELE		LAVFWRDQRG		LCALKFLKLE
DFLDNERHEV		QLDMEPQGCL		VAEVTFRNPV		IERIPRLRRQ		KKIFSKQQGK
AFQRARQMNI		DVATWVRLLR		RLIPNATGTG		TFSPGASPGS		EARTTGDISV
EKLNLGTDSD		SSPQKSSRDP		PSSPSSLSSP		IQESTAPELP		SETQETPGPA
LCSPLRKSPL		TLEDFKFLAV		LGRGHFGKVL		LSEFRPSGEL		FAIKALKKGD
IVARDEVESL		MCEKRILAAV		TSAGHPFLVN		LFGCFQTPEH		VCFVMEYSAG
GDLMLHIHSD		VFSEPRAIFY		SACVVLGLQF		LHEHKIVYRD		LKLDNLLLDT
EGYVKIADFG		LCKEGMGYGD		RTSTFCGTPE		FLAPEVLTDT		SYTRAVDWWG
LGVLLYEMLV		GESPFPGDDE		EEVFDSIVND		EVRYPRFLSA		EAIGIMRRLL
RRNPERRLGS		SERDAEDVKK		QPFFRTLGWE		ALLARRLPPP		FVPTLSGRTD
VSNFDEEFTG		EAPTLSPPRD		ARPLTAAEQA		AFLDFDFVAG		GC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• Mukai H., Ono Y. (1994). A novel protein kinase with leucine zipper-like sequences: its catalytic domain is highly homologous to that of protein kinase C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 199: 897—904. PMID 8135837 DOI:10.1006/bbrc.1994.1313
• Palmer R.H., Ridden J., Parker P.J. (1995). Cloning and expression patterns of two members of a novel protein-kinase-C-related kinase family. Eur. J. Biochem. 227: 344—351. PMID 7851406 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.tb20395.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Palmer R.H., Ridden J., Parker P.J. (1994). Identification of multiple, novel, protein kinase C-related gene products. FEBS Lett. 356: 5—8. PMID 7988719 DOI:10.1016/0014-5793(94)01202-4
• Mellor H., Flynn P., Nobes C.D., Hall A., Parker P.J. (1998). PRK1 is targeted to endosomes by the small GTPase, RhoB. J. Biol. Chem. 273: 4811—4814. PMID 9478917 DOI:10.1074/jbc.273.9.4811
• Takahashi M., Mukai H., Toshimori M., Miyamoto M., Ono Y. (1998). Proteolytic activation of PKN by caspase-3 or related protease during apoptosis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 11566—11571. PMID 9751706 DOI:10.1073/pnas.95.20.11566

Див. також

• Хромосома 19