POLD3

POLD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1U76, 3E0J, 2N1G
Ідентифікатори
Символи	POLD3, P66, P68, PPP1R128, polymerase (DNA) delta 3, accessory subunit, DNA polymerase delta 3, accessory subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 611415 MGI: 1915217 HomoloGene: 38202 GeneCards: POLD3
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак
Реагує на сполуку
Цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA-directed DNA polymerase activity Клітинна компонента • delta DNA polymerase complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • DNA synthesis involved in DNA repair • Реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • telomere maintenance • DNA-dependent DNA replication • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA mismatch repair • DNA strand elongation involved in DNA replication • DNA synthesis involved in UV-damage excision repair Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10714	67967
Ensembl	ENSG00000077514	ENSMUSG00000030726
UniProt	Q15054	Q9EQ28
RefSeq (мРНК)	NM_006591 NM_001363597	NM_133692 NM_001368380
RefSeq (білок)	NP_006582 NP_001350526	NP_598453 NP_001355309
Локус (UCSC)	Хр. 11: 74.49 – 74.67 Mb	Хр. 7: 99.73 – 99.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLD3 (англ. DNA polymerase delta 3, accessory subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 51 400.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADQLYLENI		DEFVTDQNKI		VTYKWLSYTL		GVHVNQAKQM		LYDYVERKRK
ENSGAQLHVT		YLVSGSLIQN		GHSCHKVAVV		REDKLEAVKS		KLAVTASIHV
YSIQKAMLKD		SGPLFNTDYD		ILKSNLQNCS		KFSAIQCAAA		VPRAPAESSS
SSKKFEQSHL		HMSSETQANN		ELTTNGHGPP		ASKQVSQQPK		GIMGMFASKA
AAKTQETNKE		TKTEAKEVTN		ASAAGNKAPG		KGNMMSNFFG		KAAMNKFKVN
LDSEQAVKEE		KIVEQPTVSV		TEPKLATPAG		LKKSSKKAEP		VKVLQKEKKR
GKRVALSDDE		TKETENMRKK		RRRIKLPESD		SSEDEVFPDS		PGAYEAESPS
PPPPPSPPLE		PVPKTEPEPP		SVKSSSGENK		RKRKRVLKSK		TYLDGEGCIV
TEKVYESESC		TDSEEELNMK		TSSVHRPPAM		TVKKEPREER		KGPKKGTAAL
GKANRQVSIT		GFFQRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hughes P., Tratner I., Ducoux M., Piard K., Baldacci G. (1999). Isolation and identification of the third subunit of mammalian DNA polymerase delta by PCNA-affinity chromatography of mouse FM3A cell extracts. Nucleic Acids Res. 27: 2108—2114. PMID 10219083 DOI:10.1093/nar/27.10.2108
• Mo J.-Y., Liu L., Leon A., Mazloum N., Lee M.Y.W.T. (2000). Evidence that DNA polymerase delta isolated by immunoaffinity chromatography exhibits high-molecular weight characteristics and is associated with the KIAA0039 protein and RPA. Biochemistry. 39: 7245—7254. PMID 10852724 DOI:10.1021/bi0000871
• Liu L., Rodriguez-Belmonte E.M., Mazloum N., Xie B., Lee M.Y.W.T. (2003). Identification of a novel protein, PDIP38, that interacts with the p50 subunit of DNA polymerase delta and proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 278: 10041—10047. PMID 12522211 DOI:10.1074/jbc.M208694200
• Liu G., Warbrick E. (2006). The p66 and p12 subunits of DNA polymerase delta are modified by ubiquitin and ubiquitin-like proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 349: 360—366. PMID 16934752 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.08.049
• Meng X., Zhou Y., Lee E.Y., Lee M.Y., Frick D.N. (2010). The p12 subunit of human polymerase delta modulates the rate and fidelity of DNA synthesis. Biochemistry. 49: 3545—3554. PMID 20334433 DOI:10.1021/bi100042b

Див. також

• Хромосома 11