PPFIBP1

PPFIBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3TAD
Ідентифікатори
Символи	PPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603141 MGI: 1914783 HomoloGene: 2685 GeneCards: PPFIBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • cadherin binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • focal adhesion • гіалоплазма Біологічний процес • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8496	67533
Ensembl	ENSG00000110841	ENSMUSG00000016487
UniProt	Q86W92	Q8C8U0
RefSeq (мРНК)	NM_001198915 NM_001198916 NM_003622 NM_177444	NM_001170433 NM_026221 NM_001355728 NM_001355729
RefSeq (білок)	NP_001185844 NP_001185845 NP_003613 NP_803193	NP_001163904 NP_080497 NP_001342657 NP_001342658
Локус (UCSC)	Хр. 12: 27.52 – 27.7 Mb	Хр. 6: 146.79 – 146.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPFIBP1 (англ. PPFIA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 114 024.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMSDASDMLA		AALEQMDGII		AGSKALEYSN		GIFDCQSPTS		PFMGSLRALH
LVEDLRGLLE		MMETDEKEGL		RCQIPDSTAE		TLVEWLQSQM		TNGHLPGNGD
VYQERLARLE		NDKESLVLQV		SVLTDQVEAQ		GEKIRDLEFC		LEEHREKVNA
TEEMLQQELL		SRTSLETQKL		DLMAEISNLK		LKLTAVEKDR		LDYEDKFRDT
EGLIQEINDL		RLKVSEMDSE		RLQYEKKLKS		TKSLMAKLSS		MKIKVGQMQY
EKQRMEQKWE		SLKDELASLK		EQLEEKESEV		KRLQEKLVCK		MKGEGVEIVD
RDIEVQKMKK		AVESLMAANE		EKDRKIEDLR		QCLNRYKKMQ		DTVVLAQGKD
GEYEELLNSS		SISSLLDAQG		FSDLEKSPSP		TPVMGSPSCD		PFNTSVPEEF
HTTILQVSIP		SLLPATVSME		TSEKSKLTPK		PETSFEENDG		NIILGATVDT
QLCDKLLTSS		LQKSSSLGNL		KKETSDGEKE		TIQKTSEDRA		PAESRPFGTL
PPRPPGQDTS		MDDNPFGTRK		VRSSFGRGFF		KIKSNKRTAS		APNLAETEKE
TAEHLDLAGA		SSRPKDSQRN		SPFQIPPPSP		DSKKKSRGIM		KLFGKLRRSQ
STTFNPDDMS		EPEFKRGGTR		ATAGPRLGWS		RDLGQSNSDL		DMPFAKWTKE
QVCNWLMEQG		LGSYLNSGKH		WIASGQTLLQ		ASQQDLEKEL		GIKHSLHRKK
LQLALQALGS		EEETNHGKLD		FNWVTRWLDD		IGLPQYKTQF		DEGRVDGRML
HYMTVDDLLS		LKVVSVLHHL		SIKRAIQVLR		INNFEPNCLR		RRPSDENTIA
PSEVQKWTNH		RVMEWLRSVD		LAEYAPNLRG		SGVHGGLMVL		EPRFNVETMA
QLLNIPPNKT		LLRRHLATHF		NLLIGAEAQH		QKRDAMELPD		YVLLTATAKV
KPKKLAFSNF		GNLRKKKQED		GEEYVCPMEL		GQASGSASKK		GFKPGLDMRL
YEEDDLDRLE		QMEDSEGTVR		QIGAFSEGIN		NLTHMLKEDD		MFKDFAARSP
SASITDEDSN		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12