PPIE

PPIE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZMF, 2CQB, 2KU7, 2KYX, 2R99, 3LPY, 3MDF, 3UCH
Ідентифікатори
Символи	PPIE, CYP-33, CYP33, peptidylprolyl isomerase E
Зовнішні ІД	OMIM: 602435 MGI: 1917118 HomoloGene: 38142 GeneCards: PPIE
Онтологія гена Молекулярна функція • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • cyclosporin A binding • RNA binding • mRNA binding • poly(A) binding • unfolded protein binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • Нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • extracellular region • гіалоплазма • nuclear speck • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • mRNA processing • protein peptidyl-prolyl isomerization • згортання білків • Сплайсинг РНК • positive regulation of viral genome replication • transcription-coupled nucleotide-excision repair • mRNA splicing, via spliceosome • neutrophil degranulation • protein refolding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10450	56031
Ensembl	ENSG00000084072	ENSMUSG00000028651
UniProt	Q9UNP9	Q9QZH3
RefSeq (мРНК)	NM_001195007 NM_006112 NM_203456 NM_203457 NM_001319293	NM_019489
RefSeq (білок)	NP_001181936 NP_001306222 NP_006103 NP_982281	NP_062362
Локус (UCSC)	Хр. 1: 39.69 – 39.76 Mb	Хр. 4: 123.02 – 123.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPIE (англ. Peptidylprolyl isomerase E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 33 431.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATTKRVLYV		GGLAEEVDDK		VLHAAFIPFG		DITDIQIPLD		YETEKHRGFA
FVEFELAEDA		AAAIDNMNES		ELFGRTIRVN		LAKPMRIKEG		SSRPVWSDDD
WLKKFSGKTL		EENKEEEGSE		PPKAETQEGE		PIAKKARSNP		QVYMDIKIGN
KPAGRIQMLL		RSDVVPMTAE		NFRCLCTHEK		GFGFKGSSFH		RIIPQFMCQG
GDFTNHNGTG		GKSIYGKKFD		DENFILKHTG		PGLLSMANSG		PNTNGSQFFL
TCDKTDWLDG		KHVVFGEVTE		GLDVLRQIEA		QGSKDGKPKQ		KVIIADCGEY
V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mi H., Kops O., Zimmermann E., Jaeschke A., Tropschug M. (1996). A nuclear RNA-binding cyclophilin in human T cells. FEBS Lett. 398: 201—205. PMID 8977107 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01248-3
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 1