PRAME

PRAME
Ідентифікатори
Символи	PRAME, CT130, MAPE, OIP-4, OIP4, preferentially expressed antigen in melanoma, PRAME nuclear receptor transcriptional regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 606021 HomoloGene: 48404 GeneCards: PRAME
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retinoic acid receptor binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • клітинне ядро • мембрана • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of cell differentiation • regulation of growth • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23532	н/д
Ensembl	ENSG00000185686 ENSG00000275013	н/д
UniProt	P78395	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001291715 NM_001291716 NM_001291717 NM_001291719 NM_006115 NM_206953 NM_206954 NM_206955 NM_206956 NM_001318126 NM_001318127	н/д
RefSeq (білок)	NP_001278644 NP_001278645 NP_001278646 NP_001278648 NP_001305055 NP_001305056 NP_006106 NP_996836 NP_996837 NP_996838 NP_996839	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 22.55 – 22.56 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

PRAME (англ. Preferentially expressed antigen in melanoma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 57 890.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERRRLWGSI		QSRYISMSVW		TSPRRLVELA		GQSLLKDEAL		AIAALELLPR
ELFPPLFMAA		FDGRHSQTLK		AMVQAWPFTC		LPLGVLMKGQ		HLHLETFKAV
LDGLDVLLAQ		EVRPRRWKLQ		VLDLRKNSHQ		DFWTVWSGNR		ASLYSFPEPE
AAQPMTKKRK		VDGLSTEAEQ		PFIPVEVLVD		LFLKEGACDE		LFSYLIEKVK
RKKNVLRLCC		KKLKIFAMPM		QDIKMILKMV		QLDSIEDLEV		TCTWKLPTLA
KFSPYLGQMI		NLRRLLLSHI		HASSYISPEK		EEQYIAQFTS		QFLSLQCLQA
LYVDSLFFLR		GRLDQLLRHV		MNPLETLSIT		NCRLSEGDVM		HLSQSPSVSQ
LSVLSLSGVM		LTDVSPEPLQ		ALLERASATL		QDLVFDECGI		TDDQLLALLP
SLSHCSQLTT		LSFYGNSISI		SALQSLLQHL		IGLSNLTHVL		YPVPLESYED
IHGTLHLERL		AYLHARLREL		LCELGRPSMV		WLSANPCPHC		GDRTFYDPEP
ILCPCFMPN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, регуляція росту, диференціація клітин. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Williams J.M., Chen G.-C., Zhu L., Rest R.F. (1998). Using the yeast two-hybrid system to identify human epithelial cell proteins that bind gonococcal Opa proteins: intracellular gonococci bind pyruvate kinase via their Opa proteins and require host pyruvate for growth. Mol. Microbiol. 27: 171—186. PMID 9466265 DOI:10.1046/j.1365-2958.1998.00670.x

Див. також

• Хромосома 22