PREX1

PREX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QIK, 4YON, 5D3W, 5D3V, 5FI0, 5D27, 5D3Y, 5FI1, 5D3X
Ідентифікатори
Символи	PREX1, P-REX1, phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606905 MGI: 3040696 HomoloGene: 10821 GeneCards: PREX1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • phospholipid binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • dendritic shaft • perinuclear region of cytoplasm • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • neutrophil activation • regulation of dendrite development • neutrophil chemotaxis • reactive oxygen species metabolic process • regulation of actin filament polymerization • actin filament polymerization • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • T cell differentiation • regulation of Rho protein signal transduction • superoxide metabolic process • positive regulation of cell adhesion • negative regulation of protein kinase activity • positive regulation of cell migration • negative regulation of TOR signaling • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57580	277360
Ensembl	ENSG00000124126	ENSMUSG00000039621
UniProt	Q8TCU6	Q69ZK0
RefSeq (мРНК)	NM_020820	NM_177782
RefSeq (білок)	NP_065871	NP_808450
Локус (UCSC)	Хр. 20: 48.62 – 48.83 Mb	Хр. 2: 166.41 – 166.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PREX1 (англ. Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 659 амінокислот, а молекулярна маса — 186 203.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAPSGSEPG		GDGAGDCAHP		DPRAPGAAAP		SSGPGPCAAA		RESERQLRLR
LCVLNEILGT		ERDYVGTLRF		LQSAFLHRIR		QNVADSVEKG		LTEENVKVLF
SNIEDILEVH		KDFLAALEYC		LHPEPQSQHE		LGNVFLKFKD		KFCVYEEYCS
NHEKALRLLV		ELNKIPTVRA		FLLSCMLLGG		RKTTDIPLEG		YLLSPIQRIC
KYPLLLKELA		KRTPGKHPDH		PAVQSALQAM		KTVCSNINET		KRQMEKLEAL
EQLQSHIEGW		EGSNLTDICT		QLLLQGTLLK		ISAGNIQERA		FFLFDNLLVY
CKRKSRVTGS		KKSTKRTKSI		NGSLYIFRGR		INTEVMEVEN		VEDGTADYHS
NGYTVTNGWK		IHNTAKNKWF		VCMAKTAEEK		QKWLDAIIRE		REQRESLKLG
MERDAYVMIA		EKGEKLYHMM		MNKKVNLIKD		RRRKLSTVPK		CFLGNEFVAW
LLEIGEISKT		EEGVNLGQAL		LENGIIHHVS		DKHQFKNEQV		MYRFRYDDGT
YKARSELEDI		MSKGVRLYCR		LHSLYTPVIK		DRDYHLKTYK		SVLPGSKLVD
WLLAQGDCQT		REEAVALGVG		LCNNGFMHHV		LEKSEFRDES		QYFRFHADEE
MEGTSSKNKQ		LRNDFKLVEN		ILAKRLLILP		QEEDYGFDIE		EKNKAVVVKS
VQRGSLAEVA		GLQVGRKIYS		INEDLVFLRP		FSEVESILNQ		SFCSRRPLRL
LVATKAKEII		KIPDQPDTLC		FQIRGAAPPY		VYAVGRGSEA		MAAGLCAGQC
ILKVNGSNVM		NDGAPEVLEH		FQAFRSRREE		ALGLYQWIYH		THEDAQEARA
SQEASTEDPS		GEQAQEEDQA		DSAFPLLSLG		PRLSLCEDSP		MVTLTVDNVH
LEHGVVYEYV		STAGVRCHVL		EKIVEPRGCF		GLTAKILEAF		AANDSVFVEN
CRRLMALSSA		IVTMPHFEFR		NICDTKLESI		GQRIACYQEF		AAQLKSRVSP
PFKQAPLEPH		PLCGLDFCPT		NCHINLMEVS		YPKTTPSVGR		SFSIRFGRKP
SLIGLDPEQG		HLNPMSYTQH		CITTMAAPSW		KCLPAAEGDP		QGQGLHDGSF
GPASGTLGQE		DRGLSFLLKQ		EDREIQDAYL		QLFTKLDVAL		KEMKQYVTQI
NRLLSTITEP		TSGGSCDASL		AEEASSLPLV		SEESEMDRSD		HGGIKKVCFK
VAEEDQEDSG		HDTMSYRDSY		SECNSNRDSV		LSYTSVRSNS		SYLGSDEMGS
GDELPCDMRI		PSDKQDKLHG		CLEHLFNQVD		SINALLKGPV		MSRAFEETKH
FPMNHSLQEF		KQKEECTIRG		RSLIQISIQE		DPWNLPNSIK		TLVDNIQRYV
EDGKNQLLLA		LLKCTDTELQ		LRRDAIFCQA		LVAAVCTFSK		QLLAALGYRY
NNNGEYEESS		RDASRKWLEQ		VAATGVLLHC		QSLLSPATVK		EERTMLEDIW
VTLSELDNVT		FSFKQLDENY		VANTNVFYHI		EGSRQALKVI		FYLDSYHFSK
LPSRLEGGAS		LRLHTALFTK		VLENVEGLPS		PGSQAAEDLQ		QDINAQSLEK
VQQYYRKLRA		FYLERSNLPT		DASTTAVKID		QLIRPINALD		ELCRLMKSFV
HPKPGAAGSV		GAGLIPISSE		LCYRLGACQM		VMCGTGMQRS		TLSVSLEQAA
ILARSHGLLP		KCIMQATDIM		RKQGPRVEIL		AKNLRVKDQM		PQGAPRLYRL
CQPPVDGDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20