PTPN12

PTPN12
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5J8R
Ідентифікатори
Символи	PTPN12, PTP-PEST, PTPG1, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 12
Зовнішні ІД	OMIM: 600079 MGI: 104673 HomoloGene: 37691 GeneCards: PTPN12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • non-membrane spanning protein tyrosine phosphatase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • protein tyrosine phosphatase activity;
Клітинна компонента	• podosome; • Міжклітинні контакти; • cell projection; • focal adhesion; • цитоплазма; • гіалоплазма; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• tissue regeneration; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • cellular response to epidermal growth factor stimulus; • ERBB2 signaling pathway; • negative regulation of ERBB signaling pathway; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • cellular response to cytokine stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5782
	19248
	ENSG00000127947
	ENSMUSG00000028771
	Q05209
	P35831
	NM_001131008; NM_001131009; NM_002835
	NM_011203; NM_001356590; NM_001356591; NM_001356592
	NP_001124480; NP_001124481; NP_002826
	NP_035333; NP_001343519; NP_001343520; NP_001343521
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPN12 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 780 амінокислот, а молекулярна маса — 88 106^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQVEILRKF	IQRVQAMKSP	DHNGEDNFAR	DFMRLRRLST	KYRTEKIYPT
ATGEKEENVK	KNRYKDILPF	DHSRVKLTLK	TPSQDSDYIN	ANFIKGVYGP
KAYVATQGPL	ANTVIDFWRM	IWEYNVVIIV	MACREFEMGR	KKCERYWPLY
GEDPITFAPF	KISCEDEQAR	TDYFIRTLLL	EFQNESRRLY	QFHYVNWPDH
DVPSSFDSIL	DMISLMRKYQ	EHEDVPICIH	CSAGCGRTGA	ICAIDYTWNL
LKAGKIPEEF	NVFNLIQEMR	TQRHSAVQTK	EQYELVHRAI	AQLFEKQLQL
YEIHGAQKIA	DGVNEINTEN	MVSSIEPEKQ	DSPPPKPPRT	RSCLVEGDAK
EEILQPPEPH	PVPPILTPSP	PSAFPTVTTV	WQDNDRYHPK	PVLHMVSSEQ
HSADLNRNYS	KSTELPGKNE	STIEQIDKKL	ERNLSFEIKK	VPLQEGPKSF
DGNTLLNRGH	AIKIKSASPC	IADKISKPQE	LSSDLNVGDT	SQNSCVDCSV
TQSNKVSVTP	PEESQNSDTP	PRPDRLPLDE	KGHVTWSFHG	PENAIPIPDL
SEGNSSDINY	QTRKTVSLTP	SPTTQVETPD	LVDHDNTSPL	FRTPLSFTNP
LHSDDSDSDE	RNSDGAVTQN	KTNISTASAT	VSAATSTESI	STRKVLPMSI
ARHNIAGTTH	SGAEKDVDVS	EDSPPPLPER	TPESFVLASE	HNTPVRSEWS
ELQSQERSEQ	KKSEGLITSE	NEKCDHPAGG	IHYEMCIECP	PTFSDKREQI
SENPTEATDI	GFGNRCGKPK	GPRDPPSEWT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Sahu S.N., Nunez S., Bai G., Gupta A. (2007). Interaction of Pyk2 and PTP-PEST with leupaxin in prostate cancer cells. Am. J. Physiol. 292: C2288—C2296. PMID 17329398 DOI:10.1152/ajpcell.00503.2006
Yang Q., Co D., Sommercorn J., Tonks N.K. (1993). Cloning and expression of PTP-PEST. A novel, human, nontransmembrane protein tyrosine phosphatase. J. Biol. Chem. 268: 6622—6628. PMID 8454633
Yang Q., Co D., Sommercorn J., Tonks N.K. (1993). J. Biol. Chem. 268: 17650—17650. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8349645

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9645 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q05209 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9645 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q05209 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

PTPN12

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук