RAB43

RAB43
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HUP
Ідентифікатори
Символи	RAB43, RAB11B, RAB41, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	MGI: 1917084 HomoloGene: 43122 GeneCards: RAB43
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • ендосома • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • phagocytic vesicle • екзосома • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • trans-Golgi network membrane • Golgi membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинний Біологічний процес • phagosome maturation • retrograde transport, plasma membrane to Golgi • toxin transport • Golgi organization • intracellular protein transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • Rab protein signal transduction • cellular response to interferon-gamma • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	339122	69834
Ensembl	ENSG00000172780	ENSMUSG00000030055
UniProt	Q86YS6	Q8CG50
RefSeq (мРНК)	NM_198490 NM_001204883 NM_001204884 NM_001204885 NM_001204886 NM_001204887 NM_001204888	NM_001039394 NM_133717
RefSeq (білок)	NP_001191812 NP_001191813 NP_001191814 NP_001191815 NP_001191816 NP_001191817 NP_940892	NP_001034483 NP_598478
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.09 – 129.12 Mb	Хр. 6: 87.77 – 87.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB43 (англ. RAB43, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 212 амінокислот, а молекулярна маса — 23 339.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGPGPGPGD		PDEQYDFLFK		LVLVGDASVG		KTCVVQRFKT		GAFSERQGST
IGVDFTMKTL		EIQGKRVKLQ		IWDTAGQERF		RTITQSYYRS		ANGAILAYDI
TKRSSFLSVP		HWIEDVRKYA		GSNIVQLLIG		NKSDLSELRE		VSLAEAQSLA
EHYDILCAIE		TSAKDSSNVE		EAFLRVATEL		IMRHGGPLFS		EKSPDHIQLN
SKDIGEGWGC		GC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Seto S., Tsujimura K., Koide Y. (2011). Rab GTPases regulating phagosome maturation are differentially recruited to mycobacterial phagosomes. Traffic. 12: 407—420. PMID 21255211 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01165.x

Див. також

• Хромосома 3