RAD54L

RAD54L
Ідентифікатори
Символи	RAD54L, HR54, RAD54A, hHR54, hRAD54, RAD54-like (S. cerevisiae), RAD54 like (S. cerevisiae), RAD54 like
Зовнішні ІД	OMIM: 603615 MGI: 894697 HomoloGene: 48227 GeneCards: RAD54L
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP-dependent DNA/DNA annealing activity • DNA binding • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity Клітинна компонента • Нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • response to ionizing radiation • DNA recombination • double-strand break repair • double-strand break repair via homologous recombination • determination of adult lifespan • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0007126 мейоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8438	19366
Ensembl	ENSG00000085999	ENSMUSG00000028702
UniProt	Q92698	P70270
RefSeq (мРНК)	NM_001142548 NM_003579 NM_001370766	NM_001122958 NM_001122959 NM_009015
RefSeq (білок)	NP_001136020 NP_003570 NP_001357695	NP_001116430 NP_001116431 NP_033041
Локус (UCSC)	Хр. 1: 46.25 – 46.28 Mb	Хр. 4: 115.95 – 115.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD54L (англ. RAD54 like (S. cerevisiae)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 747 амінокислот, а молекулярна маса — 84 352.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRSLAPSQL		AKRKPEGRSC		DDEDWQPGLV		TPRKRKSSSE		TQIQECFLSP
FRKPLSQLTN		QPPCLDSSQH		EAFIRSILSK		PFKVPIPNYQ		GPLGSRALGL
KRAGVRRALH		DPLEKDALVL		YEPPPLSAHD		QLKLDKEKLP		VHVVVDPILS
KVLRPHQREG		VKFLWECVTS		RRIPGSHGCI		MADEMGLGKT		LQCITLMWTL
LRQSPECKPE		IDKAVVVSPS		SLVKNWYNEV		GKWLGGRIQP		LAIDGGSKDE
IDQKLEGFMN		QRGARVSSPI		LIISYETFRL		HVGVLQKGSV		GLVICDEGHR
LKNSENQTYQ		ALDSLNTSRR		VLISGTPIQN		DLLEYFSLVH		FVNSGILGTA
HEFKKHFELP		ILKGRDAAAS		EADRQLGEER		LRELTSIVNR		CLIRRTSDIL
SKYLPVKIEQ		VVCCRLTPLQ		TELYKRFLRQ		AKPAEELLEG		KMSVSSLSSI
TSLKKLCNHP		ALIYDKCVEE		EDGFVGALDL		FPPGYSSKAL		EPQLSGKMLV
LDYILAVTRS		RSSDKVVLVS		NYTQTLDLFE		KLCRARRYLY		VRLDGTMSIK
KRAKVVERFN		SPSSPDFVFM		LSSKAGGCGL		NLIGANRLVM		FDPDWNPAND
EQAMARVWRD		GQKKTCYIYR		LLSAGTIEEK		IFQRQSHKKA		LSSCVVDEEQ
DVERHFSLGE		LKELFILDEA		SLSDTHDRLH		CRRCVNSRQI		RPPPDGSDCT
SDLAGWNHCT		DKWGLRDEVL		QAAWDAASTA		ITFVFHQRSH		EEQRGLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Golub E.I., Kovalenko O.V., Gupta R.C., Ward D.C., Radding C.M. (1997). Interaction of human recombination proteins Rad51 and Rad54. Nucleic Acids Res. 25: 4106—4110. PMID 9321665 DOI:10.1093/nar/25.20.4106
• Swagemakers S.M.A., Essers J., de Wit J., Hoeijmakers J.H.J., Kanaar R. (1998). The human RAD54 recombinational DNA repair protein is a double-stranded DNA-dependent ATPase. J. Biol. Chem. 273: 28292—28297. PMID 9774452 DOI:10.1074/jbc.273.43.28292
• Carling T., Imanishi Y., Gaz R.D., Arnold A. (1999). Analysis of the RAD54 gene on chromosome 1p as a potential tumor-suppressor gene in parathyroid adenomas. Int. J. Cancer. 83: 80—82. PMID 10449612 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19990924)83:1<80::AID-IJC15>3.0.CO;2-E
• Ristic D., Wyman C., Paulusma C., Kanaar R. (2001). The architecture of the human Rad54-DNA complex provides evidence for protein translocation along DNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 8454—8460. PMID 11459989 DOI:10.1073/pnas.151056798
• Sigurdsson S., Van Komen S., Petukhova G., Sung P. (2002). Homologous DNA pairing by human recombination factors Rad51 and Rad54. J. Biol. Chem. 277: 42790—42794. PMID 12205100 DOI:10.1074/jbc.M208004200

Див. також

• Хромосома 1