RAD9A

RAD9A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A1J, 3G65, 3GGR
Ідентифікатори
Символи	RAD9A, RAD9, RAD9 checkpoint clamp component A
Зовнішні ІД	OMIM: 603761 MGI: 1328356 HomoloGene: 32118 GeneCards: RAD9A
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • histone deacetylase binding • exodeoxyribonuclease III activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3'-5' exonuclease activity • enzyme binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • protein kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • Нуклеоплазма • checkpoint clamp complex • клітинне ядро Біологічний процес • cell cycle checkpoint signaling • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling • DNA damage checkpoint signaling • cellular response to DNA damage stimulus • DNA replication checkpoint signaling • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • cellular response to ionizing radiation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0100026 Репарація ДНК • Реплікація ДНК • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5883	19367
Ensembl	ENSG00000172613	ENSMUSG00000024824
UniProt	Q99638	Q9Z0F6
RefSeq (мРНК)	NM_001243224 NM_004584	NM_011237
RefSeq (білок)	NP_001230153 NP_004575	NP_035367
Локус (UCSC)	Хр. 11: 67.32 – 67.4 Mb	Хр. 19: 4.25 – 4.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD9A (англ. RAD9 checkpoint clamp component A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 42 547.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKCLVTGGNV		KVLGKAVHSL		SRIGDELYLE		PLEDGLSLRT		VNSSRSAYAC
FLFAPLFFQQ		YQAATPGQDL		LRCKILMKSF		LSVFRSLAML		EKTVEKCCIS
LNGRSSRLVV		QLHCKFGVRK		THNLSFQDCE		SLQAVFDPAS		CPHMLRAPAR
VLGEAVLPFS		PALAEVTLGI		GRGRRVILRS		YHEEEADSTA		KAMVTEMCLG
EEDFQQLQAQ		EGVAITFCLK		EFRGLLSFAE		SANLNLSIHF		DAPGRPAIFT
IKDSLLDGHF		VLATLSDTDS		HSQDLGSPER		HQPVPQLQAH		STPHPDDFAN
DDIDSYMIAM		ETTIGNEGSR		VLPSISLSPG		PQPPKSPGPH		SEEEDEAEPS
TVPGTPPPKK		FRSLFFGSIL		APVRSPQGPS		PVLAEDSEGE		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як пошкодження ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lieberman H.B., Hopkins K.M., Nass M., Demetrick D., Davey S. (1996). A human homolog of the Schizosaccharomyces pombe rad9+ checkpoint control gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 13890—13895. PMID 8943031 DOI:10.1073/pnas.93.24.13890
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• St Onge R.P., Udell C.M., Casselman R., Davey S. (1999). The human G2 checkpoint control protein hRAD9 is a nuclear phosphoprotein that forms complexes with hRAD1 and hHUS1. Mol. Biol. Cell. 10: 1985—1995. PMID 10359610 DOI:10.1091/mbc.10.6.1985
• Hang H., Lieberman H.B. (2000). Physical interaction among human checkpoint control proteins HUS1p, RAD1p, and RAD9p, and implications for the regulation of cell cycle progression. Genomics. 65: 24—33. PMID 10777662 DOI:10.1006/geno.2000.6142
• Bessho T., Sancar A. (2000). Human DNA damage checkpoint protein hRAD9 is a 3' to 5' exonuclease. J. Biol. Chem. 275: 7451—7454. PMID 10713044 DOI:10.1074/jbc.275.11.7451
• Cai R.L., Yan-Neale Y., Cueto M.A., Xu H., Cohen D. (2000). HDAC1, a histone deacetylase, forms a complex with Hus1 and Rad9, two G2/M checkpoint Rad proteins. J. Biol. Chem. 275: 27909—27916. PMID 10846170 DOI:10.1074/jbc.M000168200

Див. також

• Хромосома 11