RBBP6

RBBP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C7H, 2YSA, 2YUR, 3ZTG
Ідентифікатори
Символи	RBBP6, MY038, P2P-R, PACT, RBQ-1, SNAMA, retinoblastoma binding protein 6, RB binding protein 6, ubiquitin ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 600938 MGI: 894835 HomoloGene: 136812 GeneCards: RBBP6
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • RNA binding • protein kinase binding Клітинна компонента • ядерце • Центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма • Цитоскелет • гіалоплазма • центросома • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • in utero embryonic development • embryonic organ development • regulation of DNA replication • Реплікація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • Убіквітин-залежний протеоліз • multicellular organism growth • somite development • mRNA processing • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5930	19647
Ensembl	ENSG00000122257	ENSMUSG00000030779
UniProt	Q7Z6E9	P97868
RefSeq (мРНК)	NM_006910 NM_018703 NM_032626	NM_011247 NM_175023
RefSeq (білок)	NP_008841 NP_061173 NP_116015	NP_035377 NP_778188 NP_001390011 NP_001390012
Локус (UCSC)	Хр. 16: 24.54 – 24.57 Mb	Хр. 7: 122.56 – 122.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBBP6 (англ. RB binding protein 6, ubiquitin ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 792 амінокислот, а молекулярна маса — 201 564.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSCVHYKFSS		KLNYDTVTFD		GLHISLCDLK		KQIMGREKLK		AADCDLQITN
AQTKEEYTDD		NALIPKNSSV		IVRRIPIGGV		KSTSKTYVIS		RTEPAMATTK
AIDDSSASIS		LAQLTKTANL		AEANASEEDK		IKAMMSQSGH		EYDPINYMKK
PLGPPPPSYT		CFRCGKPGHY		IKNCPTNGDK		NFESGPRIKK		STGIPRSFMM
EVKDPNMKGA		MLTNTGKYAI		PTIDAEAYAI		GKKEKPPFLP		EEPSSSSEED
DPIPDELLCL		ICKDIMTDAV		VIPCCGNSYC		DECIRTALLE		SDEHTCPTCH
QNDVSPDALI		ANKFLRQAVN		NFKNETGYTK		RLRKQLPPPP		PPIPPPRPLI
QRNLQPLMRS		PISRQQDPLM		IPVTSSSTHP		APSISSLTSN		QSSLAPPVSG
NPSSAPAPVP		DITATVSISV		HSEKSDGPFR		DSDNKILPAA		ALASEHSKGT
SSIAITALME		EKGYQVPVLG		TPSLLGQSLL		HGQLIPTTGP		VRINTARPGG
GRPGWEHSNK		LGYLVSPPQQ		IRRGERSCYR		SINRGRHHSE		RSQRTQGPSL
PATPVFVPVP		PPPLYPPPPH		TLPLPPGVPP		PQFSPQFPPG		QPPPAGYSVP
PPGFPPAPAN		LSTPWVSSGV		QTAHSNTIPT		TQAPPLSREE		FYREQRRLKE
EEKKKSKLDE		FTNDFAKELM		EYKKIQKERR		RSFSRSKSPY		SGSSYSRSSY
TYSKSRSGST		RSRSYSRSFS		RSHSRSYSRS		PPYPRRGRGK		SRNYRSRSRS
HGYHRSRSRS		PPYRRYHSRS		RSPQAFRGQS		PNKRNVPQGE		TEREYFNRYR
EVPPPYDMKA		YYGRSVDFRD		PFEKERYREW		ERKYREWYEK		YYKGYAAGAQ
PRPSANRENF		SPERFLPLNI		RNSPFTRGRR		EDYVGGQSHR		SRNIGSNYPE
KLSARDGHNQ		KDNTKSKEKE		SENAPGDGKG		NKHKKHRKRR		KGEESEGFLN
PELLETSRKS		REPTGVEENK		TDSLFVLPSR		DDATPVRDEP		MDAESITFKS
VSEKDKRERD		KPKAKGDKTK		RKNDGSAVSK		KENIVKPAKG		PQEKVDGERE
RSPRSEPPIK		KAKEETPKTD		NTKSSSSSQK		DEKITGTPRK		AHSKSAKEHQ
ETKPVKEEKV		KKDYSKDVKS		EKLTTKEEKA		KKPNEKNKPL		DNKGEKRKRK
TEEKGVDKDF		ESSSMKISKL		EVTEIVKPSP		KRKMEPDTEK		MDRTPEKDKI
SLSAPAKKIK		LNRETGKKIG		STENISNTKE		PSEKLESTSS		KVKQEKVKGK
VRRKVTGTEG		SSSTLVDYTS		TSSTGGSPVR		KSEEKTDTKR		TVIKTMEEYN
NDNTAPAEDV		IIMIQVPQSK		WDKDDFESEE		EDVKSTQPIS		SVGKPASVIK
NVSTKPSNIV		KYPEKESEPS		EKIQKFTKDV		SHEIIQHEVK		SSKNSASSEK
GKTKDRDYSV		LEKENPEKRK		NSTQPEKESN		LDRLNEQGNF		KSLSQSSKEA
RTSDKHDSTR		ASSNKDFTPN		RDKKTDYDTR		EYSSSKRRDE		KNELTRRKDS
PSRNKDSASG		QKNKPREERD		LPKKGTGDSK		KSNSSPSRDR		KPHDHKATYD
TKRPNEETKS		VDKNPCKDRE		KHVLEARNNK		ESSGNKLLYI		LNPPETQVEK
EQITGQIDKS		TVKPKPQLSH		SSRLSSDLTR		ETDEAAFEPD		YNESDSESNV
SVKEEESSGN		ISKDLKDKIV		EKAKESLDTA		AVVQVGISRN		QSHSSPSVSP
SRSHSPSGSQ		TRSHSSSASS		AESQDSKKKK		KKKEKKKHKK		HKKHKKHKKH
AGTEVELEKS		QKHKHKKKKS		KKNKDKEKEK		EKDDQKVKSV		TV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). P2P-R protein localizes to the nucleolus of interphase cells and the periphery of chromosomes in mitotic cells which show maximum P2P-R immunoreactivity. J. Cell. Physiol. 191: 145—154. PMID 12064457 DOI:10.1002/jcp.10084
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). J. Cell. Physiol. 192: 359—360. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 16