RCHY1

RCHY1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JRJ, 2K2C, 2K2D
Ідентифікатори
Символи	RCHY1, ARNIP, CHIMP, PIRH2, PRO1996, RNF199, ZCHY, ZNF363, ring finger and CHY zinc finger domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607680 MGI: 1915348 HomoloGene: 22894 GeneCards: RCHY1
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • signaling receptor binding Клітинна компонента • ubiquitin ligase complex • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • error-free translesion synthesis • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein autoubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25898	68098
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000029397
UniProt	Q96PM5	Q9CR50
RefSeq (мРНК)	NM_001008925 NM_001009922 NM_001278536 NM_001278537 NM_001278538 NM_001278539 NM_015436 NM_001387136 NM_001387137	NM_001271797 NM_026557
RefSeq (білок)	NP_001009922 NP_001265465 NP_001265466 NP_001265467 NP_001265468 NP_056251	NP_001258726 NP_080833
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 5: 92.1 – 92.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RCHY1 (англ. Ring finger and CHY zinc finger domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 30 110.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAATAREDGA		SGQERGQRGC		EHYDRGCLLK		APCCDKLYTC		RLCHDNNEDH
QLDRFKVKEV		QCINCEKIQH		AQQTCEECST		LFGEYYCDIC		HLFDKDKKQY
HCENCGICRI		GPKEDFFHCL		KCNLCLAMNL		QGRHKCIENV		SRQNCPICLE
DIHTSRVVAH		VLPCGHLLHR		TCYEEMLKEG		YRCPLCMHSA		LDMTRYWRQL
DDEVAQTPMP		SEYQNMTVDI		LCNDCNGRST		VQFHILGMKC		KICESYNTAQ
AGGRRISLDQ		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Shi J., Huang Y., Sheikh M.S. (2010). Identification of Pirh2D, an additional novel isoform of Pirh2 ubiquitin ligase. Mol. Cell. Pharmacol. 2: 21—23. PMID 20357911 DOI:10.4255/mcpharmacol.10.04
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Logan I.R., Sapountzi V., Gaughan L., Neal D.E., Robson C.N. (2004). Control of human PIRH2 protein stability: involvement of TIP60 and the proteosome. J. Biol. Chem. 279: 11696—11704. PMID 14701804 DOI:10.1074/jbc.M312712200
• Zhang L., Li J., Wang C., Ma Y., Huo K. (2005). A new human gene hNTKL-BP1 interacts with hPirh2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 330: 293—297. PMID 15781263 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.02.156
• Zheng G., Ning J., Yang Y.-C. (2007). PLAGL2 controls the stability of Pirh2, an E3 ubiquitin ligase for p53. Biochem. Biophys. Res. Commun. 364: 344—350. PMID 17950244 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.10.003
• Wu H., Zeinab R.A., Flores E.R., Leng R.P. (2011). Pirh2, a ubiquitin E3 ligase, inhibits p73 transcriptional activity by promoting its ubiquitination. Mol. Cancer Res. 9: 1780—1790. PMID 21994467 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-11-0157

Див. також

• Хромосома 4