RNF11

RNF11
Ідентифікатори
Символи	RNF11, SID1669, CGI-123, ring finger protein 11
Зовнішні ІД	OMIM: 612598 MGI: 1352759 HomoloGene: 32195 GeneCards: RNF11
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • ubiquitin ligase complex • цитоплазма • recycling endosome • ендосома • early endosome • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26994	29864
Ensembl	ENSG00000123091	ENSMUSG00000028557
UniProt	Q9Y3C5	Q9QYK7
RefSeq (мРНК)	NM_014372	NM_013876
RefSeq (білок)	NP_055187	NP_038904
Локус (UCSC)	Хр. 1: 51.24 – 51.27 Mb	Хр. 4: 109.31 – 109.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF11 (англ. Ring finger protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 154 амінокислот, а молекулярна маса — 17 444.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNCLKSPTS		DDISLLHESQ		SDRASFGEGT		EPDQEPPPPY		QEQVPVPVYH
PTPSQTRLAT		QLTEEEQIRI		AQRIGLIQHL		PKGVYDPGRD		GSEKKIRECV
ICMMDFVYGD		PIRFLPCMHI		YHLDCIDDWL		MRSFTCPSCM		EPVDAALLSS
YETN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендосомах.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Connor M.K., Azmi P.B., Subramaniam V., Li H., Seth A.K. (2005). Molecular characterization of ring finger protein 11. Mol. Cancer Res. 3: 453—461. PMID 16123141 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-04-0166
• Li H., Seth A.K. (2004). An RNF11: Smurf2 complex mediates ubiquitination of the AMSH protein. Oncogene. 23: 1801—1808. PMID 14755250 DOI:10.1038/sj.onc.1207319
• Shembade N., Parvatiyar K., Harhaj N.S., Harhaj E.W. (2009). The ubiquitin-editing enzyme A20 requires RNF11 to downregulate NF-kappaB signalling. EMBO J. 28: 513—522. PMID 19131965 DOI:10.1038/emboj.2008.285
• Scheper J., Oliva B., Villa-Freixa J., Thomson T.M. (2009). Analysis of electrostatic contributions to the selectivity of interactions between RING-finger domains and ubiquitin-conjugating enzymes. Proteins. 74: 92—103. PMID 18615712 DOI:10.1002/prot.22120

Див. також

• Хромосома 1