RNF139

RNF139
Ідентифікатори
Символи	RNF139, HRCA1, RCA1, TRC8, ring finger protein 139
Зовнішні ІД	OMIM: 603046 MGI: 1923091 HomoloGene: 5222 GeneCards: RNF139
Пов'язані генетичні захворювання
nonpapillary renal cell carcinoma
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin-like protein transferase activity • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • ligase activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • Derlin-1 retrotranslocation complex • endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment • система ендомембран Біологічний процес • negative regulation of translation • ERAD pathway • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • regulation of protein ubiquitination • protein polyubiquitination • regulation of protein processing • positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein destabilization • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of cell population proliferation • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • endoplasmic reticulum mannose trimming • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11236	75841
Ensembl	ENSG00000170881	ENSMUSG00000037075
UniProt	Q8WU17	Q7TMV1
RefSeq (мРНК)	NM_007218	NM_175226
RefSeq (білок)	NP_009149	NP_780435
Локус (UCSC)	Хр. 8: 124.47 – 124.49 Mb	Хр. 15: 58.76 – 58.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF139 (англ. Ring finger protein 139) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 994.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVGPPQQQ		VRMAHQQVWA		ALEVALRVPC		LYIIDAIFNS		YPDSSQSRFC
IVLQIFLRLF		GVFASSIVLI		LSQRSLFKFY		TYSSAFLLAA		TSVLVNYYAS
LHIDFYGAYN		TSAFGIELLP		RKGPSLWMAL		IVLQLTFGIG		YVTLLQIHSI
YSQLIILDLL		VPVIGLITEL		PLHIRETLLF		TSSLILTLNT		VFVLAVKLKW
FYYSTRYVYL		LVRHMYRIYG		LQLLMEDTWK		RIRFPDILRV		FWLTRVTAQA
TVLMYILRMA		NETDSFFISW		DDFWDLICNL		IISGCDSTLT		VLGMSAVISS
VAHYLGLGIL		AFIGSTEEDD		RRLGFVAPVL		FFILALQTGL		SGLRPEERLI
RLSRNMCLLL		TAVLHFIHGM		TDPVLMSLSA		SHVSSFRRHF		PVLFVSACLF
ILPVLLSYVL		WHHYALNTWL		FAVTAFCVEL		CLKVIVSLTV		YTLFMIDGYY
NVLWEKLDDY		VYYVRSTGSI		IEFIFGVVMF		GNGAYTMMFE		SGSKIRAFMM
CLHAYFNIYL		QAKNGWKTFM		NRRTAVKKIN		SLPEIKGSRL		QEINDVCAIC
YHEFTTSARI		TPCNHYFHAL		CLRKWLYIQD		TCPMCHQKVY		IEDDIKDNSN
VSNNNGFIPP		NETPEEAVRE		AAAESDRELN		EDDSTDCDDD		VQRERNGVIQ
HTGAAAEEFN		DDTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376

Див. також

• Хромосома 8