RNF38

RNF38
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X4J, 4V3K, 4V3L
Ідентифікатори
Символи	RNF38, ring finger protein 38
Зовнішні ІД	OMIM: 612488 MGI: 1920719 HomoloGene: 32550 GeneCards: RNF38
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • sperm flagellum • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • male gonad development • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	152006	73469
Ensembl	ENSG00000137075	ENSMUSG00000035696
UniProt	Q9H0F5	Q8BI21
RefSeq (мРНК)	NM_022781 NM_194328 NM_194329 NM_194330 NM_194331 NM_194332	NM_001038993 NM_175201 NM_001355181 NM_001379574 NM_001379575 NM_001379576 NM_001379577 NM_001379578 NM_001379579 NM_001379580 NM_001379581
RefSeq (білок)	NP_073618 NP_919309 NP_919310 NP_919311 NP_919313	NP_001034082 NP_780410 NP_001342110 NP_001366503 NP_001366504 NP_001366505 NP_001366506 NP_001366507 NP_001366508 NP_001366509 NP_001366510
Локус (UCSC)	Хр. 9: 36.34 – 36.49 Mb	Хр. 4: 44.13 – 44.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF38 (англ. Ring finger protein 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 515 амінокислот, а молекулярна маса — 57 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MACKISPGAN		SASLPGHPNK		VICERVRLQS		LFPLLPSDQN		TTVQEDAHFK
AFFQSEDSPS		PKRQRLSHSV		FDYTSASPAP		SPPMRPWEMT		SNRQPPSVRP
SQHHFSGERC		NTPARNRRSP		PVRRQRGRRD		RLSRHNSISQ		DENYHHLPYA
QQQAIEEPRA		FHPPNVSPRL		LHPAAHPPQQ		NAVMVDIHDQ		LHQGTVPVSY
TVTTVAPHGI		PLCTGQHIPA		CSTQQVPGCS		VVFSGQHLPV		CSVPPPMLQA
CSVQHLPVPY		AAFPPLISSD		PFLIHPPHLS		PHHPPHLPPP		GQFVPFQTQQ
SRSPLQRIEN		EVELLGEHLP		VGGFTYPPSA		HPPTLPPSAP		LQFLTHDPLH
QEVSFGVPYP		PFMPRRLTGR		SRYRSQQPIP		PPPYHPSLLP		YVLSMLPVPP
AVGPTFSFEL		DVEDGEVENY		EALLNLAERL		GEAKPRGLTK		ADIEQLPSYR
FNPNNHQSEQ		TLCVVCMCDF		ESRQLLRVLP		CNHEFHAKCV		DKWLKANRTC
PICRADASEV		HRDSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sheren J.E., Kassenbrock C.K. (2013). RNF38 encodes a nuclear ubiquitin protein ligase that modifies p53. Biochem. Biophys. Res. Commun. 440: 473—478. PMID 23973461 DOI:10.1016/j.bbrc.2013.08.031

Див. також

• Хромосома 9