RNF8

RNF8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CSW, 2PIE, 4AYC, 4ORH, 4WHV
Ідентифікатори
Символи	RNF8, hring finger protein 8
Зовнішні ІД	OMIM: 611685 MGI: 1929069 HomoloGene: 2944 GeneCards: RNF8
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • identical protein binding • zinc ion binding • ubiquitin binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • site of double-strand break • ubiquitin ligase complex • Нуклеоплазма • хромосома • теломера • midbody • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • response to ionizing radiation • histone H2A ubiquitination • interstrand cross-link repair • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein K63-linked ubiquitination • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • histone H2A K63-linked ubiquitination • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • protein K48-linked ubiquitination • Перемикання класу імуноглобулінів • Убіквітин-залежний протеоліз • spermatid development • клітинний цикл • histone H2B ubiquitination • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0035042 histone exchange • protein autoubiquitination • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9025	58230
Ensembl	ENSG00000112130	ENSMUSG00000090083
UniProt	O76064	Q8VC56
RefSeq (мРНК)	NM_003958 NM_183078	NM_021419
RefSeq (білок)	NP_003949 NP_898901	NP_067394
Локус (UCSC)	Хр. 6: 37.35 – 37.39 Mb	Хр. 17: 29.83 – 29.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF8 (англ. Ring finger protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 55 518.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEPGFFVTG		DRAGGRSWCL		RRVGMSAGWL		LLEDGCEVTV		GRGFGVTYQL
VSKICPLMIS		RNHCVLKQNP		EGQWTIMDNK		SLNGVWLNRA		RLEPLRVYSI
HQGDYIQLGV		PLENKENAEY		EYEVTEEDWE		TIYPCLSPKN		DQMIEKNKEL
RTKRKFSLDE		LAGPGAEGPS		NLKSKINKVS		CESGQPVKSQ		GKGEVASTPS
DNLDPKLTAL		EPSKTTGAPI		YPGFPKVTEV		HHEQKASNSS		ASQRSLQMFK
VTMSRILRLK		IQMQEKHEAV		MNVKKQTQKG		NSKKVVQMEQ		ELQDLQSQLC
AEQAQQQARV		EQLEKTFQEE		EQHLQGLEIA		QGEKDLKQQL		AQALQEHWAL
MEELNRSKKD		FEAIIQAKNK		ELEQTKEEKE		KMQAQKEEVL		SHMNDVLENE
LQCIICSEYF		IEAVTLNCAH		SFCSYCINEW		MKRKIECPIC		RKDIKSKTYS
LVLDNCINKM		VNNLSSEVKE		RRIVLIRERK		AKRLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang B., Elledge S.J. (2007). Ubc13/Rnf8 ubiquitin ligases control foci formation of the Rap80/Abraxas/Brca1/Brcc36 complex in response to DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 20759—20763. PMID 18077395 DOI:10.1073/pnas.0710061104
• Plans V., Guerra-Rebollo M., Thomson T.M. (2008). Regulation of mitotic exit by the RNF8 ubiquitin ligase. Oncogene. 27: 1355—1365. PMID 17724460 DOI:10.1038/sj.onc.1210782
• Sakasai R., Tibbetts R. (2008). RNF8-dependent and RNF8-independent regulation of 53BP1 in response to DNA damage. J. Biol. Chem. 283: 13549—13555. PMID 18337245 DOI:10.1074/jbc.M710197200
• Gong Z., Cho Y.-W., Kim J.-E., Ge K., Chen J. (2009). Accumulation of Pax2 transactivation domain interaction protein (PTIP) at sites of DNA breaks via RNF8-dependent pathway is required for cell survival after DNA damage. J. Biol. Chem. 284: 7284—7293. PMID 19124460 DOI:10.1074/jbc.M809158200
• Shanbhag N.M., Rafalska-Metcalf I.U., Balane-Bolivar C., Janicki S.M., Greenberg R.A. (2010). ATM-dependent chromatin changes silence transcription in cis to DNA double-strand breaks. Cell. 141: 970—981. PMID 20550933 DOI:10.1016/j.cell.2010.04.038

Див. також

• Хромосома 6