RPTOR

RPTOR
Ідентифікатори
Символи	RPTOR, KOG1, Mip1, regulatory associated protein of MTOR complex 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607130 MGI: 1921620 HomoloGene: 80210 GeneCards: RPTOR
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Реагує на сполуку
indoximod
Онтологія гена Молекулярна функція • 14-3-3 protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • TFIIIC-class transcription factor complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • protein-macromolecule adaptor activity • protein kinase activator activity • protein serine/threonine kinase inhibitor activity Клітинна компонента • lysosomal membrane • цитоплазма • TORC1 complex • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • Нуклеоплазма • гіалоплазма • cytoplasmic stress granule • лізосома Біологічний процес • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of endothelial cell proliferation • regulation of phosphorylation • positive regulation of TOR signaling • cellular response to nutrient levels • TOR signaling • cellular response to amino acid stimulus • regulation of cell size • positive regulation of transcription by RNA polymerase III • regulation of cellular response to heat • activation of protein kinase activity • cellular response to starvation • regulation of autophagy • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of cell growth • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • TORC1 signaling • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • regulation of macroautophagy • cellular response to leucine • regulation of cell growth • GO:0022415 viral process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57521	74370
Ensembl	ENSG00000141564	ENSMUSG00000025583
UniProt	Q8N122	Q8K4Q0
RefSeq (мРНК)	NM_020761 NM_001163034	NM_028898 NM_001306081
RefSeq (білок)	NP_001156506 NP_065812	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 80.54 – 80.97 Mb	Хр. 11: 119.49 – 119.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPTOR (англ. Regulatory associated protein of MTOR complex 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 335 амінокислот, а молекулярна маса — 149 038.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESEMLQSPL		LGLGEEDEAD		LTDWNLPLAF		MKKRHCEKIE		GSKSLAQSWR
MKDRMKTVSV		ALVLCLNVGV		DPPDVVKTTP		CARLECWIDP		LSMGPQKALE
TIGANLQKQY		ENWQPRARYK		QSLDPTVDEV		KKLCTSLRRN		AKEERVLFHY
NGHGVPRPTV		NGEVWVFNKN		YTQYIPLSIY		DLQTWMGSPS		IFVYDCSNAG
LIVKSFKQFA		LQREQELEVA		AINPNHPLAQ		MPLPPSMKNC		IQLAACEATE
LLPMIPDLPA		DLFTSCLTTP		IKIALRWFCM		QKCVSLVPGV		TLDLIEKIPG
RLNDRRTPLG		ELNWIFTAIT		DTIAWNVLPR		DLFQKLFRQD		LLVASLFRNF
LLAERIMRSY		NCTPVSSPRL		PPTYMHAMWQ		AWDLAVDICL		SQLPTIIEEG
TAFRHSPFFA		EQLTAFQVWL		TMGVENRNPP		EQLPIVLQVL		LSQVHRLRAL
DLLGRFLDLG		PWAVSLALSV		GIFPYVLKLL		QSSARELRPL		LVFIWAKILA
VDSSCQADLV		KDNGHKYFLS		VLADPYMPAE		HRTMTAFILA		VIVNSYHTGQ
EACLQGNLIA		ICLEQLNDPH		PLLRQWVAIC		LGRIWQNFDS		ARWCGVRDSA
HEKLYSLLSD		PIPEVRCAAV		FALGTFVGNS		AERTDHSTTI		DHNVAMMLAQ
LVSDGSPMVR		KELVVALSHL		VVQYESNFCT		VALQFIEEEK		NYALPSPATT
EGGSLTPVRD		SPCTPRLRSV		SSYGNIRAVA		TARSLNKSLQ		NLSLTEESGG
AVAFSPGNLS		TSSSASSTLG		SPENEEHILS		FETIDKMRRA		SSYSSLNSLI
GVSFNSVYTQ		IWRVLLHLAA		DPYPEVSDVA		MKVLNSIAYK		ATVNARPQRV
LDTSSLTQSA		PASPTNKGVH		IHQAGGSPPA		SSTSSSSLTN		DVAKQPVSRD
LPSGRPGTTG		PAGAQYTPHS		HQFPRTRKMF		DKGPEQTADD		ADDAAGHKSF
ISATVQTGFC		DWSARYFAQP		VMKIPEEHDL		ESQIRKEREW		RFLRNSRVRR
QAQQVIQKGI		TRLDDQIFLN		RNPGVPSVVK		FHPFTPCIAV		ADKDSICFWD
WEKGEKLDYF		HNGNPRYTRV		TAMEYLNGQD		CSLLLTATDD		GAIRVWKNFA
DLEKNPEMVT		AWQGLSDMLP		TTRGAGMVVD		WEQETGLLMS		SGDVRIVRIW
DTDREMKVQD		IPTGADSCVT		SLSCDSHRSL		IVAGLGDGSI		RVYDRRMALS
ECRVMTYREH		TAWVVKASLQ		KRPDGHIVSV		SVNGDVRIFD		PRMPESVNVL
QIVKGLTALD		IHPQADLIAC		GSVNQFTAIY		NSSGELINNI		KYYDGFMGQR
VGAISCLAFH		PHWPHLAVGS		NDYYISVYSV		EKRVR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, лізосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Sun C., Southard C., Di Rienzo A. (2009). Characterization of a novel splicing variant in the RAPTOR gene. Mutat. Res. 662: 88—92. PMID 19388141 DOI:10.1016/j.mrfmmm.2009.01.001
• Schalm S.S., Fingar D.C., Sabatini D.M., Blenis J. (2003). TOS motif-mediated raptor binding regulates 4E-BP1 multisite phosphorylation and function. Curr. Biol. 13: 797—806. PMID 12747827 DOI:10.1016/S0960-9822(03)00329-4
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• So E.Y., Ouchi T. (2013). The potential role of BRCA1-associated ATM activator-1 (BRAT1) in regulation of mTOR. J. Cancer. Biol. Res. 1: —. PMID 25657994

Див. також

• Хромосома 17