RRP8

RRP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZFU
Ідентифікатори
Символи	RRP8, KIAA0409, NML, ribosomal RNA processing 8, methyltransferase, homolog (yeast), ribosomal RNA processing 8
Зовнішні ІД	OMIM: 615818 MGI: 1914251 HomoloGene: 5621 GeneCards: RRP8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • Нуклеоплазма • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • cellular response to glucose starvation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription by glucose • transcription, DNA-templated • Метилювання • rDNA heterochromatin assembly • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • rRNA processing • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23378	101867
Ensembl	ENSG00000132275	ENSMUSG00000030888
UniProt	O43159	Q9DB85
RefSeq (мРНК)	NM_015324	NM_025897 NM_133951
RefSeq (білок)	NP_056139	NP_080173 NP_598712
Локус (UCSC)	Хр. 11: 6.6 – 6.6 Mb	Хр. 7: 105.38 – 105.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRP8 (англ. Ribosomal RNA processing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 456 амінокислот, а молекулярна маса — 50 715.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFEEPEWAEA		APVAAGLGPV		ISRPPPAASS		QNKGSKRRQL		LATLRALEAA
SLSQHPPSLC		ISDSEEEEEE		RKKKCPKKAS		FASASAEVGK		KGKKKCQKQG
PPCSDSEEEV		ERKKKCHKQA		LVGSDSAEDE		KRKRKCQKHA		PINSAQHLDN
VDQTGPKAWK		GSTTNDPPKQ		SPGSTSPKPP		HTLSRKQWRN		RQKNKRRCKN
KFQPPQVPDQ		APAEAPTEKT		EVSPVPRTDS		HEARAGALRA		RMAQRLDGAR
FRYLNEQLYS		GPSSAAQRLF		QEDPEAFLLY		HRGFQSQVKK		WPLQPVDRIA
RDLRQRPASL		VVADFGCGDC		RLASSIRNPV		HCFDLASLDP		RVTVCDMAQV
PLEDESVDVA		VFCLSLMGTN		IRDFLEEANR		VLKPGGLLKV		AEVSSRFEDV
RTFLRAVTKL		GFKIVSKDLT		NSHFFLFDFQ		KTGPPLVGPK		AQLSGLQLQP
CLYKRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесінг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11