SAP30

SAP30
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KDP
Ідентифікатори
Символи	SAP30, Sin3A associated protein 30
Зовнішні ІД	OMIM: 603378 MGI: 1929129 HomoloGene: 2869 GeneCards: SAP30
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • histone deacetylase activity Клітинна компонента • histone deacetylase complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • skeletal muscle cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone deacetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8819	60406
Ensembl	ENSG00000164105	ENSMUSG00000031609
UniProt	O75446	O88574
RefSeq (мРНК)	NM_003864	NM_021788
RefSeq (білок)	NP_003855	NP_068560.1
Локус (UCSC)	Хр. 4: 173.37 – 173.38 Mb	Хр. 8: 57.94 – 57.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SAP30 (англ. Sin3A associated protein 30) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 23 306.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGFTPDEMS		RGGDAAAAVA		AVVAAAAAAA		SAGNGTGAGT		GAEVPGAGAV
SAAGPPGAAG		PGPGQLCCLR		EDGERCGRAA		GNASFSKRIQ		KSISQKKVKI
ELDKSARHLY		ICDYHKNLIQ		SVRNRRKRKG		SDDDGGDSPV		QDIDTPEVDL
YQLQVNTLRR		YKRHFKLPTR		PGLNKAQLVE		IVGCHFRSIP		VNEKDTLTYF
IYSVKNDKNK		SDLKVDSGVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
• He Y., Imhoff R., Sahu A., Radhakrishnan I. (2009). Solution structure of a novel zinc finger motif in the SAP30 polypeptide of the Sin3 corepressor complex and its potential role in nucleic acid recognition. Nucleic Acids Res. 37: 2142—2152. PMID 19223330 DOI:10.1093/nar/gkp051

Див. також

• Хромосома 4