SAP30L

SAP30L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2N1U
Ідентифікатори
Символи	SAP30L, NS4ATP2, SAP30-like, SAP30 like
Зовнішні ІД	OMIM: 610398 MGI: 1354709 HomoloGene: 11632 GeneCards: SAP30L
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • histone deacetylase activity • zinc ion binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • nucleosome binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • GO:0031493 histone binding • non-sequence-specific DNA binding, bending • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • Нуклеоплазма • histone deacetylase complex Біологічний процес • transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79685	50724
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000020519
UniProt	Q9HAJ7	Q5SQF8
RefSeq (мРНК)	NM_001131062 NM_001131063 NM_024632	NM_001081168
RefSeq (білок)	NP_001124534 NP_001124535 NP_078908	NP_001074637
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 11: 57.69 – 57.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SAP30L (англ. SAP30 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 183 амінокислот, а молекулярна маса — 20 877.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGFSTEEDS		REGPPAAPAA		AAPGYGQSCC		LIEDGERCVR		PAGNASFSKR
VQKSISQKKL		KLDIDKSVRH		LYICDFHKNF		IQSVRNKRKR		KTSDDGGDSP
EHDTDIPEVD		LFQLQVNTLR		RYKRHYKLQT		RPGFNKAQLA		ETVSRHFRNI
PVNEKETLAY		FIYMVKSNKS		RLDQKSEGGK		QLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Assmann E.M., Alborghetti M.R., Camargo M.E.R., Kobarg J. (2006). FEZ1 dimerization and interaction with transcription regulatory proteins involves its coiled-coil region. J. Biol. Chem. 281: 9869—9881. PMID 16484223 DOI:10.1074/jbc.M513280200
• Korkeamaeki H., Viiri K., Kukkonen M.K., Maeki M., Lohi O. (2008). Alternative mRNA splicing of SAP30L regulates its transcriptional repression activity. FEBS Lett. 582: 379—384. PMID 18070604 DOI:10.1016/j.febslet.2007.11.084

Див. також

• Хромосома 5