SARS-CoV-2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
Ілюстрація віріону SARS-CoV-2
Віріон SARS-CoV-2
Ілюстрація поперечного перерізу віріонів SARS-CoV-2 із внутрішніми компонентами
Будова віріона
Класифікація вірусів редагувати
(без рангу): Віруси (Virus)
Реалм: Riboviria
Тип: incertae sedis
Ряд: Nidovirales
Родина: Коронавіруси (Coronaviridae)
Рід: Бетакоронавіруси (Betacoronavirus)
Підрід: Sarbecovirus
Вид:
Strain:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
SARS-CoV-2. Карта розташування: Китайська Народна Республіка
SARS-CoV-2
Ухань, КНР, епіцентр поширення вірусу
Синоніми
Commons-logo.svg Вікісховище: SARS-CoV-2

SARS-CoV-2 (скорочено від англ. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2)[3], раніше відомий як новий коронавірус 2019 (2019-nCoV)[4][5] — одноланцюговий РНК-вмісний штам виду SARSr-CoV роду бетакоронавірусів, що вперше був генетично виявлений 2019 року в пробі пацієнта з атиповою пневмонією під час спалаху пневмонії в Ухані 2019—2020 років[6][7][8]. За даними Всесвітньої організації охорони здоров'я (ВООЗ), передача цього вірусу можлива від людини до людини повітряно-крапельним шляхом у межах сімей пацієнтів, тому можливі ширші спалахи.

Затверджена ВООЗ назва хвороби — коронавірусна хвороба 2019[9], скорочена офіційна назва Covid-2019 або COVID-19, що є абревіатурою від англ. Coronavirus disease 2019, де взято для скорочення Coronavirus disease[10][11][12]. Разом із запровадженням нової назви вірусу, ВООЗ 11 лютого 2020 року відзначили його спорідненість з вірусом SARS-CoV, що спричинив у 2002—2004 роках тяжкий гострий респіраторний синдром (SARS)[13]. Наразі не існує специфічного лікування нової коронавірусної хвороби, але наявні противірусні препарати можуть бути призначені лікарем[14].

Назва[ред. | ред. код]

На початку пандемії вірус в народі називали «коронавірусом», «новим коронавірусом» та «коронавірусом Уханя». 30 січня в своїй доповіді ВООЗ рекомендує тимчасове позначення «2019-nCoV», тоді як постійна назва буде визначена в документі МКХ згодом[15]. Через обурення жителів міста Ухань з приводу вживання назви коронавірус Уханя, 9 лютого Державний комітет КНР з охорони здоров'я присвоїв тимчасову офіційну назву вірусу «Нова коронавірусна пневмонія» (англ. Novel Coronavirus Pneumonia NCP)[16][17].

11 лютого 2020 року на брифінгу в Женеві генеральний директор ВООЗ заявив, що офіційно затверджено назву вірусу нового коронавірусу 2019-nCoV — SARS-CoV-2 від «Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2», і захворювання, спричинене ним, отримало назву коронавірусна хвороба 2019, скорочено COVID-19[12], CO в назві означає «корона» (англ. corona), VI — «вірус» (англ. virus), а D — «захворювання» (англ. disease).

Походження[ред. | ред. код]

Нуклеотидні послідовності нового бетакоронавірусу виявляють схожість з бетакоронавірусами, виявленими у кажанів. Однак вірус генетично відрізняється від інших коронавірусів, зокрема збудника тяжкого гострого респіраторного синдрому (SARS-CoV) та близькосхідного коронавірусного респіраторного синдрому (MERS-CoV)[8]. Як і SARS-CoV, він є членом лінії Beta-CoV B[18].

Описані п'ять генів нового коронавірусу: «BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-01/2019», «BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-04/2020», «BetaCoV / Wuhan / IVDC-HB-05/2019», «BetaCoV / Wuhan / WIV04 / 2019» та «BetaCoV / Wuhan / IPBCAMS-WH-01/2019». Дослідження проведені в Національному інституті контролю та профілактики вірусних захворювань, Інституту патогенної біології та лікарні Уханя[8][19][20]. Послідовність одноланцюгової молекули РНК становить приблизно 30 тисяч нуклеотидів.

Аналіз, проведений дослідницькою групою з Уханського інституту вірусології показав, що геном цього коронавірусу на 96 % ідентичний геному коронавірусу кажанів. Вірус SARS-CoV-2 імовірно утворився від дикого предка десь у листопаді 2019 року. Вірус-предок майже напевно був вірусом, який наявний у організмі кажанів, не завдаючи їм шкоди (як і SARS-CoV), але циркулює в одного або кількох видів тварин, з якими могли контактувати люди. Імовірно, ці види тварин (природний резервуар) потрапили на ринок в Ухані. Попередник SARS-CoV-2 існував протягом певного невстановленого часу, ніколи не заражаючи людей, поки випадково не мутував, що перетворило його на сучасний SARS-CoV-2, який здатен заражати людину[21].

У березні-квітні 2020 року фахівці докладно розглядали можливість штучного походження SARS-CoV-2, і досягли висновку, що імовірність цього є надзвичайно малою: людство ще не досягло настільки високих технологій.[22][23][24][25]

30 квітня 2020 Національна розвідка США заявила, що коронавірус SARS CoV-2 не було створено штучно або генетично модифіковано.[26]

3 травня 2020 держсекретар США Майк Помпео заявив про те, що США мають докази лабораторного походження вірусу, і що його розробили в лабораторії в місті Ухань[27].

Властивості віріонів[ред. | ред. код]

Оболонка[ред. | ред. код]

Як і в інших коронавірусів оболонку SARS-CoV-2 утворюють 4 білки: білок «шипа», нуклеокапсидний білок, мембранний білок, білок суперкапсиду. Білок «шипа», або S-білок є тримером, тобто утворюється 3 однаковими субодиницями. Цей тример містить 6 рецептор-зв'язувальних доменів, які призводять до зв'язування з мембранним білком АПФ-2, що є рецептором для проникнення вірусу всередину клітини.[28] На відміну від близького вірусу SARS-CoV, цей вірус еволюціонував убік більш щільної взаємодії з білком АПФ-2, що призводить до кращого проникнення в клітину.[29]

Передача та збереження в середовищі[ред. | ред. код]

Основним чинником, що призводить до передачі вірусних частинок є потрапляння крапель слизу з ними від зараженої людини до слизових оболонок інших людей. Оскільки краплі слизу значно важче повітря, вони не затримуються в вигляді аерозолю, а падають на різні поверхні, де їх може торкнутися здорова людина, а потім перенести їх на слизову ока, рота чи носа, необережно доторкнувшись їх.[30] Дослідження лабораторії США, препринт якого був опублікований 10 березня 2020 року, свідчить, що вірус може існувати в краплях рідини на сталевих і пластикових поверхнях впродовж 7-24 годин, а окремі частинки виявляються впродовж 2-3 діб. На мідній поверхні вірусні частинки детектуються впродовж 2-4 годин, а за 8 годин зникають. Утім у реальних умовах поза лабораторією ці показники можуть відрізнятися.[31]

Згідно досліджень у Франції, при знаходженні в середовищі з температурою 92°С протягом 15 хвилин вірус гине (зменшується на 98%), при знаходженні в середовищі при температурі 60°С протягом 60 хвилин, кількість копій вірусу знижується на 44%, при знаходженні в середовищі при температурі 56°С протягом 30 хвилин, кількість копій вірусу знижується на 36%[32].

Початок пандемії[ред. | ред. код]

Перші випадки зараження вірусом відбулися в грудні 2019 року в Китаї.

Станом на 8 лютого 2020 року у світі було лабораторно підтверджено 34 909 випадків гострої респіраторної хвороби, спричиненої коронавірусом SARS-CoV-2, з них 724 закінчились смертю[33]. Переважна кількість випадків зафіксовані в Китаї, але інфікованих було виявлено у 24 інших країнах світу[34]. 7 лютого Міністерство охорони здоров'я України розпочало перемовини про евакуацію українських громадян з Уханя й інших міст провінції Хубей[34]. 20 лютого українські громадяни, які прибули з КНР літаком в аеропорт Харків, були звідти доправлені автобусами до Нових Санжар і розміщені там у медичному центрі Нацгвардії України на 14 діб для обсервації. Також, на круїзному лайнері «Diamond Princess», що належить Японії було виявлено 135 осіб, котрі заразилися новим коронавірусом SARS-CoV-2, із них двоє — громадяни України, що працювали на лайнері й які, станом на 20 лютого, повністю видужали.[35]

11 березня 2020 року ВООЗ офіційно оголосила пандемію коронавірусу у світі. Востаннє до того ВООЗ оголошувала пандемію 2009 року під час спалаху «свинячого грипу» H1N1[36].

Станом на 27 березня в світі кількість інфікованих досягла 543,418 осіб, з них 25,039 померли і 125,911 подолали хворобу.[37] За іншим джерелом - 553 244 хворих, 24 906 померло і 127 567 людей ви́хворіли. В Україні станом на 09.05.2020 хворих: 14 710 осіб, одужали: 2 909 осіб, померли: 376 осіб.

Мутація[ред. | ред. код]

SARS-CoV-2 повільно змутував у форму, яка менше небезпечна для людини. Зокрема, вважається, що у SARS-CoV-2 знизилися можливості з'єднання з рецептором ACE2 на клітинах людини[38][39].

Див. також[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Fox, Dan (2020). What you need to know about the Wuhan coronavirus. Nature. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/d41586-020-00209-y. 
  2. а б Zhang, Y.-Z. (12 January 2020). Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome (en). Bethesda MD. Процитовано 13 January 2020. 
  3. Coronavirus disease named Covid-19. bbc.com (англійською). BBC News. 2020-02-11. Процитовано 4 березня 2020. 
  4. Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV). who.int. ВООЗ. 2020-01-10. Архів оригіналу за 2020-02-02. 
  5. Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China. Cdc.gov. 10 January 2020. Процитовано 16 January 2020. 
  6. 中国疾病预防控制中心. www.chinacdc.cn. Процитовано 9 January 2020. 
  7. New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert – Xinhua | English.news.cn. www.xinhuanet.com. Процитовано 9 January 2020. 
  8. а б в CoV2020. platform.gisaid.org. Процитовано 12 January 2020. 
  9. Coronavirus disease 2019 (COVID-19). Situation Report — 23 (англ.)
  10. Page, Michael Le. Covid-19: The new coronavirus disease now officially has a name. New Scientist (en-US). Процитовано 2020-03-22. 
  11. Coronavirus disease named Covid-19. BBC News (en-GB). 2020-02-11. Процитовано 2020-02-11. 
  12. а б Коронавірус-вбивця отримав офіційну назву. УНІАН. Процитовано 11 лютого 2020. 
  13. COVID-19 | SARS-CoV-2 Coronavirus Portal. Global Biodefense (en-US). Процитовано 2020-03-22. 
  14. WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide. Reuters (en). 2020-01-14. Процитовано 2020-03-22. 
  15. ВООЗ запропонувала тимчасову назву для китайського коронавіруса. rbc.ua. Процитовано 11 лютого 2020. 
  16. У Китаї дали тимчасову офіційну назву коронавірусу. day.kyiv.ua. Процитовано 11 лютого 2020. 
  17. Коронавірус отримав тимчасову офіційну назву. Українська правда. Процитовано 11 лютого 2020. 
  18. Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses. nextstrain. Процитовано 18 January 2020. 
  19. Initial genome release of novel coronavirus. Virological (en-US). 11 January 2020. Процитовано 12 January 2020. 
  20. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate Wuhan-Hu-1, complete genome (en-US). 2020-03-18. Процитовано 2020-03-22. 
  21. Begley, Sharon (2020-01-25). DNA sleuths read the coronavirus genome, tracing its origins. STAT (en-US). Процитовано 2020-03-22. 
  22. The proximal origin of SARS-CoV-2 // Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes & Robert F. Garry, Nature Medicine[en], volume 26, pages 450–452 (2020), Published: 17 March 2020
  23. Конспировирусология // scinquisitor, 23 March 2020 21:55, livejournal
  24. SARS нерукотворный? Генеалогия уханьского коронавируса // YuriDeigin, 20 апреля 2020 в 01:20, Хабр
  25. Совпадение? Не думаю... // Yegor Voronin (shvarz), 24 апреля 2020, 14:34, livejournal
  26. Коронавірус не було створено штучно - розвідка США // РБК-Україна, 30.04.2020 17:59
  27. США мають докази, що коронавірус поширився з лабораторії в Ухані - Помпео. РБК-Україна. 03 травня 2020 19:46. 
  28. Wrapp, Daniel; Wang, Nianshuang; Corbett, Kizzmekia S.; Goldsmith, Jory A.; Hsieh, Ching-Lin; Abiona, Olubukola; Graham, Barney S.; McLellan, Jason S. (2020). Cryo-EM structure of the 2019-nCoV spike in the prefusion conformation. Science 367 (6483): 1260–1263. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.abb2507. (англ.)
  29. Andersen, Kristian G.; Rambaut, Andrew; Lipkin, W. Ian; Holmes, Edward C.; Garry, Robert F. (2020). The proximal origin of SARS-CoV-2. Nature Medicine. ISSN 1078-8956. doi:10.1038/s41591-020-0820-9. 
  30. How COVID-19 Is Spread. The Scientist Magazine (en). Процитовано 2020-03-22. 
  31. SARS-CoV-2 Can Live on Plastic and Steel for 2–3 Days. The Scientist Magazine (en). Процитовано 2020-03-22. 
  32. Pastorino, Boris; Touret, Franck; Gilles, Magali; Lamballerie, Xavier de; Charrel, Remi N. (2020-04-20). Evaluation of heating and chemical protocols for inactivating SARS-CoV-2. bioRxiv (en). с. 2020.04.11.036855. doi:10.1101/2020.04.11.036855. Процитовано 2020-06-28. 
  33. У МОЗ надали оперативну інформацію про поширення нового коронавірусу. Інформаційне агентство Українські Національні Новини (УНН) (uk). 2020-02-08. Процитовано 2020-03-22. 
  34. а б Україна веде переговори про евакуацію 50 громадян з Уханя – МОЗ. Радіо Свобода. 7 лютого 2020. Процитовано 2020-02-10. 
  35. Небезпечний коронавірус підхопили двоє українців, які працювали на круїзному лайнері. Українська правда (uk). Процитовано 2020-02-12. 
  36. ВООЗ оголосила пандемію коронавірусу у світі. РБК-Украина. Процитовано 2020-03-11. 
  37. Coronavirus Dashboard. ncov2019.live (en). Процитовано 2020-03-22. 
  38. Коронавирус ослабевает: ученые обнаружили первую значительную мутацию Covid-19
  39. Analysis of the mutation dynamics of SARS-CoV-2 reveals the spread history and emergence of RBD mutant with lower ACE2 binding affinity

Посилання[ред. | ред. код]