SCLT1

SCLT1
Ідентифікатори
Символи	SCLT1, CAP-1A, CAP1A, sodium channel and clathrin linker 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611399 MGI: 1914411 HomoloGene: 27031 GeneCards: SCLT1
Пов'язані генетичні захворювання
хронічне обструктивне захворювання легень
Онтологія гена Молекулярна функція • clathrin binding • sodium channel regulator activity • protein C-terminus binding Клітинна компонента • цитоплазма • Клатрин • Центріоль • гіалоплазма • центросома • цитоскелет • ciliary transition fiber Біологічний процес • clustering of voltage-gated sodium channels • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	132320	67161
Ensembl	ENSG00000151466	ENSMUSG00000059834
UniProt	Q96NL6	G5E861
RefSeq (мРНК)	NM_001300897 NM_001300898 NM_144643	NM_001081411
RefSeq (білок)	NP_001287826 NP_001287827 NP_653244	NP_001074880
Локус (UCSC)	Хр. 4: 128.86 – 129.09 Mb	Хр. 3: 41.58 – 41.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCLT1 (англ. Sodium channel and clathrin linker 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 688 амінокислот, а молекулярна маса — 80 910.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEIDFLRE		QNRRLNEDFR		RYQMESFSKY		SSVQKAVCQG		EGDDTFENLV
FDQSFLAPLV		TEYDKHLGEL		NGQLKYYQKQ		VGEMKLQLEN		VIKENERLHS
ELKDAVEKKL		EAFPLGTEVG		TDIYADDETV		RNLQEQLQLA		NQEKTQAVEL
WQTVSQELDR		LHKLYQEHMT		EAQIHVFESQ		KQKDQLFDFQ		QLTKQLHVTN
ENMEVTNQQF		LKTVTEQSVI		IEQLRKKLRQ		AKLELRVAVA		KVEELTNVTE
DLQGQMKKKE		KDVVSAHGRE		EASDRRLQQL		QSSIKQLEIR		LCVTIQEANQ
LRTENTHLEK		QTRELQAKCN		ELENERYEAI		VRARNSMQLL		EEANLQKSQA
LLEEKQKEED		IEKMKETVSR		FVQDATIRTK		KEVANTKKQC		NIQISRLTEE
LSALQMECAE		KQGQIERVIK		EKKAVEEELE		KIYREGRGNE		SDYRKLEEMH
QRFLVSERSK		DDLQLRLTRA		ENRIKQLETD		SSEEISRYQE		MIQKLQNVLE
SERENCGLVS		EQRLKLQQEN		KQLRKETESL		RKIALEAQKK		AKVKISTMEH
EFSIKERGFE		VQLREMEDSN		RNSIVELRHL		LATQQKAANR		WKEETKKLTE
SAEIRINNLK		SELSRQKLHT		QELLSQLEMA		NEKVAENEKL		ILEHQEKANR
LQRRLSQAEE		RAASASQQLS		VITVQRRKAA		SLMNLENI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4