SDCBP2

SDCBP2
Ідентифікатори
Символи	SDCBP2, SITAC, SITAC18, ST-2, syndecan binding protein 2, ST2
Зовнішні ІД	OMIM: 617358 MGI: 2385156 HomoloGene: 9240 GeneCards: SDCBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • identical protein binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • екзосома • клітинне ядро • Нуклеоплазма • ядерце • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • nuclear speck Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • intracellular transport • нейробіологія розвитку • проліферація Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27111	228765
Ensembl	ENSG00000125775	ENSMUSG00000027456
UniProt	Q9H190	Q99JZ0
RefSeq (мРНК)	NM_080489 NM_001199784 NM_015685	NM_145535
RefSeq (білок)	NP_001186713 NP_056500 NP_536737	NP_663510
Локус (UCSC)	Хр. 20: 1.31 – 1.33 Mb	Хр. 2: 151.41 – 151.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDCBP2 (англ. Syndecan binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 292 амінокислот, а молекулярна маса — 31 594.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSLYPSLED		LKVDQAIQAQ		VRASPKMPAL		PVQATAISPP		PVLYPNLAEL
ENYMGLSLSS		QEVQESLLQI		PEGDSTAVSG		PGPGQMVAPV		TGYSLGVRRA
EIKPGVREIH		LCKDERGKTG		LRLRKVDQGL		FVQLVQANTP		ASLVGLRFGD
QLLQIDGRDC		AGWSSHKAHQ		VVKKASGDKI		VVVVRDRPFQ		RTVTMHKDSM
GHVGFVIKKG		KIVSLVKGSS		AARNGLLTNH		YVCEVDGQNV		IGLKDKKIME
ILATAGNVVT		LTIIPSVIYE		HMVKKLPPVL		LHHTMDHSIP		DA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Koroll M., Rathjen F.G., Volkmer H. (2001). The neural cell recognition molecule neurofascin interacts with syntenin-1 but not with syntenin-2, both of which reveal self-associating activity. J. Biol. Chem. 276: 10646—10654. PMID 11152476 DOI:10.1074/jbc.M010647200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20