SEC16B

SEC16B
Ідентифікатори
Символи	SEC16B, LZTR2, PGPR-p117, RGPR, SEC16S, SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor, RGPR-p117
Зовнішні ІД	OMIM: 612855 MGI: 2148802 HomoloGene: 13227 GeneCards: SEC16B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • endoplasmic reticulum exit site Біологічний процес • peroxisome organization • endoplasmic reticulum organization • peroxisome fission • COPII vesicle coating • GO:1901313 positive regulation of gene expression • protein transport • vesicle-mediated transport • positive regulation of protein exit from endoplasmic reticulum • Golgi organization • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	89866	89867
Ensembl	ENSG00000120341	ENSMUSG00000026589
UniProt	Q96JE7	Q91XT4
RefSeq (мРНК)	NM_033127 NM_001356499 NM_001356500 NM_001390833 NM_001390834 NM_001390835	NM_001159986 NM_033354
RefSeq (білок)	NP_149118 NP_001343428 NP_001343429	NP_001153458 NP_203505
Локус (UCSC)	Хр. 1: 177.92 – 177.98 Mb	Хр. 1: 157.33 – 157.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEC16B (англ. SEC16 homolog B, endoplasmic reticulum export factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 116 604.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELWAPQRLP		QTRGKATAPS		KDPDRGFRRD		GHHRPVPHSW		HNGERFHQWQ
DNRGSPQPQQ		EPRADHQQQP		HYASRPGDWH		QPVSGVDYYE		GGYRNQLYSR
PGYENSYQSY		QSPTMREEYA		YGSYYYHGHP		QWLQEERVPR		QRSPYIWHED
YREQKYLDEH		HYENQHSPFG		TNSETHFQSN		SRNPCKDSPA		SNSGQEWPGE
LFPGSLLAEA		QKNKPSLASE		SNLLQQRESG		LSSSSYELSQ		YIRDAPERDD
PPASAAWSPV		QADVSSAGPK		APMKFYIPHV		PVSFGPGGQL		VHVGPSSPTD
GQAALVELHS		MEVILNDSEE		QEEMRSFSGP		LIREDVHKVD		IMTFCQQKAA
QSCKSETLGS		RDSALLWQLL		VLLCRQNGSM		VGSDIAELLM		QDCKKLEKYK
RQPPVANLIN		LTDEDWPVLS		SGTPNLLTGE		IPPSVETPAQ		IVEKFTRLLY
YGRKKEALEW		AMKNHLWGHA		LFLSSKMDPQ		TYSWVMSGFT		STLALNDPLQ
TLFQLMSGRI		PQAATCCGEK		QWGDWRPHLA		VILSNQAGDP		ELYQRAIVAI
GDTLAGKGLV		EAAHFCYLMA		HVPFGHYTVK		TDHLVLLGSS		HSQEFLKFAT
TEAIQRTEIF		EYCQMLGRPK		SFIPSFQVYK		LLYASRLADY		GLVSQALHYC
EAIGAAVLSQ		GESSHPVLLV		ELIKLAEKLK		LSDPLVLERR		SGDRDLEPDW
LAQLRRQLEQ		KVAGDIGDPH		PTRSDISGAG		GTTTENTFYQ		DFSGCQGYSE
APGYRSALWL		TPEQTCLLQP		SPQQPFPLQP		GSYPAGGGAG		QTGTPRPFYS
VPETHLPGTG		SSVAVTEATG		GTVWEEMLQT		HLGPGENTVS		QETSQPPDGQ
EVISKPQTPL		AARPRSISES		SASSAKEDEK		ESSDEADKNS		PRNTAQRGKL
GDGKEHTKSS		GFGWFSWFRS		KPTKNASPAG		DEDSSDSPDS		EETPRASSPH
QAGLGLSLTP		SPESPPLPDV		SAFSRGRGGG		EGRGSASSGG		AAAGAGVGGL
SGPESVSFEL		CSNPGVLLPP		PALKGAVPLY		NPSQVPQLPT		ATSLNRPNRL
AQRRYPTQPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Bhattacharyya D., Glick B.S. (2007). Two mammalian Sec16 homologues have nonredundant functions in endoplasmic reticulum (ER) export and transitional ER organization. Mol. Biol. Cell. 18: 839—849. PMID 17192411 DOI:10.1091/mbc.E06-08-0707
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Misawa H., Yamaguchi M. (2002). Gene expression for a novel protein RGPR-p117 in various species: the stimulation by intracellular signaling factors. J. Cell. Biochem. 87: 188—193. PMID 12244571 DOI:10.1002/jcb.10289
• Misawa H., Yamaguchi M. (2001). Molecular cloning and sequencing of the cDNA coding for a novel regucalcin gene promoter region-related protein in rat, mouse and human liver. Int. J. Mol. Med. 8: 513—520. PMID 11605020

Див. також

• Хромосома 1