SEC24D

SEC24D
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EFO, 3EG9
Ідентифікатори
Символи	SEC24D, CLCRP2, SEC24 homolog D, COPII coat complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 607186 MGI: 1916858 HomoloGene: 40986 GeneCards: SEC24D
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • COPII vesicle coat • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • in utero embryonic development • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9871	69608
Ensembl	ENSG00000150961	ENSMUSG00000039234
UniProt	O94855	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_014822 NM_001318066	NM_027135
RefSeq (білок)	NP_001304995 NP_055637	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 118.72 – 118.84 Mb	Хр. 3: 123.06 – 123.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEC24D (англ. SEC24 homolog D, COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 113 010.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQQGYVATP		PYSQPQPGIG		LSPPHYGHYG		DPSHTASPTG		MMKPAGPLGA
TATRGMLPPG		PPPPGPHQFG		QNGAHATGHP		PQRFPGPPPV		NNVASSHAPY
QPSAQSSYPG		PISTSSVTQL		GSQLSAMQIN		SYGSGMAPPS		QGPPGPLSAT
SLQTPPRPPQ		PSILQPGSQV		LPPPPTTLNG		PGASPLPLPM		YRPDGLSGPP
PPNAQYQPPP		LPGQTLGAGY		PPQQANSGPQ		MAGAQLSYPG		GFPGGPAQMA
GPPQPQKKLD		PDSIPSPIQV		IENDRASRGG		QVYATNTRGQ		IPPLVTTDCM
IQDQGNASPR		FIRCTTYCFP		CTSDMAKQAQ		IPLAAVIKPF		ATIPSNESPL
YLVNHGESGP		VRCNRCKAYM		CPFMQFIEGG		RRYQCGFCNC		VNDVPPFYFQ
HLDHIGRRLD		HYEKPELSLG		SYEYVATLDY		CRKSKPPNPP		AFIFMIDVSY
SNIKNGLVKL		ICEELKTMLE		KIPKEEQEET		SAIRVGFITY		NKVLHFFNVK
SNLAQPQMMV		VTDVGEVFVP		LLDGFLVNYQ		ESQSVIHNLL		DQIPDMFADS
NENETVFAPV		IQAGMEALKA		ADCPGKLFIF		HSSLPTAEAP		GKLKNRDDKK
LVNTDKEKIL		FQPQTNVYDS		LAKDCVAHGC		SVTLFLFPSQ		YVDVASLGLV
PQLTGGTLYK		YNNFQMHLDR		QQFLNDLRND		IEKKIGFDAI		MRVRTSTGFR
ATDFFGGILM		NNTTDVEMAA		IDCDKAVTVE		FKHDDKLSED		SGALIQCAVL
YTTISGQRRL		RIHNLGLNCS		SQLADLYKSC		ETDALINFFA		KSAFKAVLHQ
PLKVIREILV		NQTAHMLACY		RKNCASPSAA		SQLILPDSMK		VLPVYMNCLL
KNCVLLSRPE		ISTDERAYQR		QLVMTMGVAD		SQLFFYPQLL		PIHTLDVKST
MLPAAVRCSE		SRLSEEGIFL		LANGLHMFLW		LGVSSPPELI		QGIFNVPSFA
HINTDMTLLP		EVGNPYSQQL		RMIMGIIQQK		RPYSMKLTIV		KQREQPEMVF
RQFLVEDKGL		YGGSSYVDFL		CCVHKEICQL		LN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Tang B.L., Kausalya J., Low D.Y.H., Lock M.L., Hong W. (1999). A family of mammalian proteins homologous to yeast Sec24p. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 679—684. PMID 10329445 DOI:10.1006/bbrc.1999.0574
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
• Bonnon C., Wendeler M.W., Paccaud J.P., Hauri H.P. (2010). Selective export of human GPI-anchored proteins from the endoplasmic reticulum. J. Cell Sci. 123: 1705—1715. PMID 20427317 DOI:10.1242/jcs.062950
• Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208
• Ma W., Goldberg J. (2016). TANGO1/cTAGE5 receptor as a polyvalent template for assembly of large COPII coats. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 10061—10066. PMID 27551091 DOI:10.1073/pnas.1605916113

Див. також

• Хромосома 4