SEPT9

SEPT9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4YQF
Ідентифікатори
Символи	SEPTIN9, AF17q25, MSF, MSF1, NAPB, PNUTL4, SINT1, SeptD1, septin 9, SEPT9
Зовнішні ІД	OMIM: 604061 MGI: 1858222 HomoloGene: 90949 GeneCards: SEPTIN9
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic neuralgia
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • cadherin binding • GO:0032947 molecular adaptor activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • GO:0035085 Аксонема • septin complex • мікротрубочка • Цитоскелет • stress fiber • actin cytoskeleton • цитоплазма • non-motile cilium • septin ring • microtubule cytoskeleton Біологічний процес • поділ клітини • клітинний цикл • positive regulation of non-motile cilium assembly • protein heterooligomerization • cilium assembly • cytoskeleton-dependent cytokinesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10801	53860
Ensembl	ENSG00000282302 ENSG00000184640	ENSMUSG00000059248
UniProt	Q9UHD8	Q80UG5
RefSeq (мРНК)	NM_001113491 NM_001113492 NM_001113493 NM_001113494 NM_001113495 NM_001113496 NM_001293695 NM_001293696 NM_001293697 NM_001293698 NM_006640	NM_001113486 NM_001113487 NM_001113488 NM_017380
RefSeq (білок)	NP_001106963 NP_001106964 NP_001106965 NP_001106966 NP_001106967 NP_001106968 NP_001280624 NP_001280625 NP_001280626 NP_001280627 NP_006631	NP_001106958 NP_001106959 NP_001106960 NP_059076
Локус (UCSC)	Хр. 17: 77.28 – 77.5 Mb	Хр. 11: 117.09 – 117.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEPT9 (англ. Septin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 65 401.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKKSYSGGTR		TSSGRLRRLG		DSSGPALKRS		FEVEEVETPN		STPPRRVQTP
LLRATVASST		QKFQDLGVKN		SEPSARHVDS		LSQRSPKASL		RRVELSGPKA
AEPVSRRTEL		SIDISSKQVE		NAGAIGPSRF		GLKRAEVLGH		KTPEPAPRRT
EITIVKPQES		AHRRMEPPAS		KVPEVPTAPA		TDAAPKRVEI		QMPKPAEAPT
APSPAQTLEN		SEPAPVSQLQ		SRLEPKPQPP		VAEATPRSQE		ATEAAPSCVG
DMADTPRDAG		LKQAPASRNE		KAPVDFGYVG		IDSILEQMRR		KAMKQGFEFN
IMVVGQSGLG		KSTLINTLFK		SKISRKSVQP		TSEERIPKTI		EIKSITHDIE
EKGVRMKLTV		IDTPGFGDHI		NNENCWQPIM		KFINDQYEKY		LQEEVNINRK
KRIPDTRVHC		CLYFIPATGH		SLRPLDIEFM		KRLSKVVNIV		PVIAKADTLT
LEERVHFKQR		ITADLLSNGI		DVYPQKEFDE		DSEDRLVNEK		FREMIPFAVV
GSDHEYQVNG		KRILGRKTKW		GTIEVENTTH		CEFAYLRDLL		IRTHMQNIKD
ITSSIHFEAY		RVKRLNEGSS		AMANGMEEKE		PEAPEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Osaka M., Rowley J.D., Zeleznik-Le N.J. (1999). MSF (MLL septin-like fusion), a fusion partner gene of MLL, in a therapy-related acute myeloid leukemia with a t(11;17)(q23;q25). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6428—6433. PMID 10339604 DOI:10.1073/pnas.96.11.6428
• Kalikin L.M., Sims H.L., Petty E.M. (2000). Genomic and expression analyses of alternatively spliced transcripts of the MLL septin-like fusion gene (MSF) that map to a 17q25 region of loss in breast and ovarian tumors. Genomics. 63: 165—172. PMID 10673329 DOI:10.1006/geno.1999.6077
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagata K., Asano T., Nozawa Y., Inagaki M. (2004). Biochemical and cell biological analyses of a mammalian septin complex, Sept7/9b/11. J. Biol. Chem. 279: 55895—55904. PMID 15485874 DOI:10.1074/jbc.M406153200
• Hall P.A., Jung K., Hillan K.J., Russell S.E.H. (2005). Expression profiling the human septin gene family. J. Pathol. 206: 269—278. PMID 15915442 DOI:10.1002/path.1789
• Nagata K., Inagaki M. (2005). Cytoskeletal modification of Rho guanine nucleotide exchange factor activity: identification of a Rho guanine nucleotide exchange factor as a binding partner for Sept9b, a mammalian septin. Oncogene. 24: 65—76. PMID 15558029 DOI:10.1038/sj.onc.1208101

Див. також

• Хромосома 17