SF3A3

SF3A3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DT7
Ідентифікатори
Символи	SF3A3, PRP9, PRPF9, SAP61, SF3a60, splicing factor 3a subunit 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605596 MGI: 1922312 HomoloGene: 4949 GeneCards: SF3A3
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • U2 snRNP • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • U2-type prespliceosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10946	75062
Ensembl	ENSG00000183431	ENSMUSG00000028902
UniProt	Q12874	Q9D554
RefSeq (мРНК)	NM_006802 NM_001320830	NM_029157
RefSeq (білок)	NP_001307759 NP_006793	NP_083433
Локус (UCSC)	Хр. 1: 37.96 – 37.99 Mb	Хр. 4: 124.61 – 124.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SF3A3 (англ. Splicing factor 3a subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 58 849.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METILEQQRR		YHEEKERLMD		VMAKEMLTKK		STLRDQINSD		HRTRAMQDRY
MEVSGNLRDL		YDDKDGLRKE		ELNAISGPNE		FAEFYNRLKQ		IKEFHRKHPN
EICVPMSVEF		EELLKARENP		SEEAQNLVEF		TDEEGYGRYL		DLHDCYLKYI
NLKASEKLDY		ITYLSIFDQL		FDIPKERKNA		EYKRYLEMLL		EYLQDYTDRV
KPLQDQNELF		GKIQAEFEKK		WENGTFPGWP		KETSSALTHA		GAHLDLSAFS
SWEELASLGL		DRLKSALLAL		GLKCGGTLEE		RAQRLFSTKG		KSLESLDTSL
FAKNPKSKGT		KRDTERNKDI		AFLEAQIYEY		VEILGEQRHL		THENVQRKQA
RTGEEREEEE		EEQISESESE		DEENEIIYNP		KNLPLGWDGK		PIPYWLYKLH
GLNINYNCEI		CGNYTYRGPK		AFQRHFAEWR		HAHGMRCLGI		PNTAHFANVT
QIEDAVSLWA		KLKLQKASER		WQPDTEEEYE		DSSGNVVNKK		TYEDLKRQGL
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Chiara M.D., Champion-Arnaud P., Buvoli M., Nadal-Ginard B., Reed R. (1994). Specific protein-protein interactions between the essential mammalian spliceosome-associated proteins SAP 61 and SAP 114. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6403—6407. PMID 8022796 DOI:10.1073/pnas.91.14.6403
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 1