SHISA6

SHISA6
Ідентифікатори
Символи	SHISA6, shisa family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 617327 MGI: 2685725 HomoloGene: 66164 GeneCards: SHISA6
Пов'язані генетичні захворювання
аметропія, ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • PDZ domain binding • ionotropic glutamate receptor binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • AMPA glutamate receptor complex • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • asymmetric, glutamatergic, excitatory synapse • клітинна мембрана • Міжклітинні контакти • синапс • postsynaptic membrane • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane • dendritic spine membrane Біологічний процес • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • Сперматогенез • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • excitatory chemical synaptic transmission • regulation of AMPA glutamate receptor clustering • Wnt signaling pathway • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity • postsynaptic neurotransmitter receptor diffusion trapping • regulation of AMPA receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	388336	380702
Ensembl	ENSG00000188803	ENSMUSG00000053930
UniProt	Q6ZSJ9	Q3UH99
RefSeq (мРНК)	NM_001173461 NM_001173462 NM_175903 NM_207386	NM_001034874
RefSeq (білок)	NP_001166932 NP_001166933 NP_997269	NP_001030046
Локус (UCSC)	Хр. 17: 11.24 – 11.56 Mb	Хр. 11: 66.1 – 66.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SHISA6 (англ. Shisa family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 55 764.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRRLLLLL		LLSLESLDLL		PSVHGARGRA		ANRTLSAGGA		AVGGRRAGGA
LARGGRELNG		TARAPGIPEA		GSRRGQPAAA		VAAAASAAVT		YETCWGYYDV
SGQYDKEFEC		NNSESGYLYC		CGTCYYRFCC		KKRHEKLDQR		QCTNYQSPVW
VQTPSTKVVS		PGPENKYDPE		KDKTNFTVYI		TCGVIAFVIV		AGVFAKVSYD
KAHRPPREMN		IHRALADILR		QQGPIPIAHC		ERETISAIDT		SPKENTPVRS
SSKNHYTPVR		TAKQTPEKPR		MNNILTSATE		PYDLSFSRSF		QNLAHLPPSY
ESAVKTNPSK		YSSLKRLTDK		EADEYYMRRR		HLPDLAARGT		LPLNVIQMSQ
QKPLPRERPR		RPIRAMSQDR		VLSPDRGLPD		EFSMPYDRIL		SDEQLLSTER
LHSQDPLLSP		ERTAFPEQSL		SRAISHTDVF		VSTPVLDRYR		MSKMHSHPSA
SNNSYATLGQ		SQTAAKRHAF		ASRRHNTVEQ		LHYIPGHHTC		YTASKTEVTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Див. також

• Хромосома 17