SIRT6

SIRT6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3K35, 3PKI, 3PKJ, 3ZG6
Ідентифікатори
Символи	SIRT6, SIR2L6, sirtuin 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606211 MGI: 1354161 HomoloGene: 6924 GeneCards: SIRT6
Онтологія гена Молекулярна функція • NAD-dependent histone deacetylase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein deacetylase activity • zinc ion binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • hydrolase activity • NAD-dependent protein deacetylase activity • NAD+ binding • GO:0106274 NAD+-protein-arginine ADP-ribosyltransferase activity • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific) • histone deacetylase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • Нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of glycolytic process • glucose homeostasis • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • positive regulation of fibroblast proliferation • protein deacetylation • negative regulation of glucose import • response to nutrient levels • protein destabilization • post-embryonic cardiac muscle cell growth involved in heart morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of stem cell proliferation • base-excision repair • negative regulation of cell population proliferation • histone deacetylation • histone H3-K9 modification • histone H3-K9 deacetylation • protein ADP-ribosylation • positive regulation of telomere maintenance • positive regulation of chondrocyte proliferation • positive regulation of blood vessel branching • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • positive regulation of cold-induced thermogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3 deacetylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51548	50721
Ensembl	ENSG00000077463	ENSMUSG00000034748
UniProt	Q8N6T7	P59941
RefSeq (мРНК)	NM_001193285 NM_016539 NM_001321058 NM_001321059 NM_001321060 NM_001321061 NM_001321062 NM_001321063 NM_001321064	NM_001163430 NM_181586 NM_001378944 NM_001378945
RefSeq (білок)	NP_001180214 NP_001307987 NP_001307988 NP_001307989 NP_001307990 NP_001307991 NP_001307992 NP_001307993 NP_057623	NP_001156902 NP_853617 NP_001365873 NP_001365874
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.17 – 4.18 Mb	Хр. 10: 81.46 – 81.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIRT6 (англ. Sirtuin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 355 амінокислот, а молекулярна маса — 39 119.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVNYAAGLS		PYADKGKCGL		PEIFDPPEEL		ERKVWELARL		VWQSSSVVFH
TGAGISTASG		IPDFRGPHGV		WTMEERGLAP		KFDTTFESAR		PTQTHMALVQ
LERVGLLRFL		VSQNVDGLHV		RSGFPRDKLA		ELHGNMFVEE		CAKCKTQYVR
DTVVGTMGLK		ATGRLCTVAK		ARGLRACRGE		LRDTILDWED		SLPDRDLALA
DEASRNADLS		ITLGTSLQIR		PSGNLPLATK		RRGGRLVIVN		LQPTKHDRHA
DLRIHGYVDE		VMTRLMKHLG		LEIPAWDGPR		VLERALPPLP		RPPTPKLEPK
EESPTRINGS		IPAGPKQEPC		AQHNGSEPAS		PKRERPTSPA		PHRPPKRVKA
KAVPS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Frye R.A. (2000). Phylogenetic classification of prokaryotic and eukaryotic Sir-2 like proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 273: 793—798. PMID 10873683 DOI:10.1006/bbrc.2000.3000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Michishita E., Park J.Y., Burneskis J.M., Barrett J.C., Horikawa I. (2005). Evolutionarily conserved and nonconserved cellular localizations and functions of human SIRT proteins. Mol. Biol. Cell. 16: 4623—4635. PMID 16079181 DOI:10.1091/mbc.E05-01-0033
• Kaidi A., Weinert B.T., Choudhary C., Jackson S.P. (2010). Human SIRT6 promotes DNA end resection through CtIP deacetylation. Science. 329: 1348—1353. PMID 20829486 DOI:10.1126/science.1192049

Див. також

• Хромосома 19