SLMAP

SLMAP
Ідентифікатори
Символи	SLMAP, SLAP, sarcolemma associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 602701 MGI: 1933549 HomoloGene: 31428 GeneCards: SLMAP
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • smooth endoplasmic reticulum • цитоплазма • integral component of membrane • Сарколема • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Цитоскелет • мембрана • Центр організації мікротрубочок Біологічний процес • м'язове скорочення • protein localization to plasma membrane • regulation of membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • regulation of sodium ion transmembrane transport • regulation of voltage-gated sodium channel activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7871	83997
Ensembl	ENSG00000163681	ENSMUSG00000021870
UniProt	Q14BN4	Q3URD3
RefSeq (мРНК)	NM_001304420 NM_001304421 NM_001304422 NM_001304423 NM_001311178 NM_001311179 NM_007159 NM_001377538 NM_001377539 NM_001377540 NM_001377541 NM_001377542 NM_001377545 NM_001377549 NM_001377551 NM_001377552 NM_001377555 NM_001377557 NM_001377559 NM_001377562 NM_001377921 NM_001377922 NM_001377923 NM_001377924 NM_001377925 NM_001377926 NM_001377927 NM_001377928	NM_032008 NM_001310445 NM_001347494
RefSeq (білок)	NP_001291349 NP_001291350 NP_001291351 NP_001291352 NP_001298107 NP_001298108 NP_009090	NP_001297374 NP_001334423 NP_114397
Локус (UCSC)	Хр. 3: 57.76 – 57.93 Mb	Хр. 14: 26.41 – 26.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLMAP (англ. Sarcolemma associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 95 198.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSALAIFTC		RPNSHPFQER		HVYLDEPIKI		GRSVARCRPA		QNNATFDCKV
LSRNHALVWF		DHKTGKFYLQ		DTKSSNGTFI		NSQRLSRGSE		ESPPCEILSG
DIIQFGVDVT		ENTRKVTHGC		IVSTIKLFLP		DGMEARLRSD		VIHAPLPSPV
DKVAANTPSM		YSQELFQLSQ		YLQEALHREQ		MLEQKLATLQ		RLLAITQEAS
DTSWQALIDE		DRLLSRLEVM		GNQLQACSKN		QTEDSLRKEL		IALQEDKHNY
ETTAKESLRR		VLQEKIEVVR		KLSEVERSLS		NTEDECTHLK		EMNERTQEEL
RELANKYNGA		VNEIKDLSDK		LKVAEGKQEE		IQQKGQAEKK		ELQHKIDEME
EKEQELQAKI		EALQADNDFT		NERLTALQVR		LEHLQEKTLK		ECSSLEHLLS
KSGGDCTFIH		QFIECQKKLI		VEGHLTKAVE		ETKLSKENQT		RAKESDFSDT
LSPSKEKSSD		DTTDAQMDEQ		DLNEPLAKVS		LLKDDLQGAQ		SEIEAKQEIQ
HLRKELIEAQ		ELARTSKQKC		FELQALLEEE		RKAYRNQVEE		STKQIQVLQA
QLQRLHIDTE		NLREEKDSEI		TSTRDELLSA		RDEILLLHQA		AAKVASERDT
DIASLQEELK		KVRAELERWR		KAASEYEKEI		TSLQNSFQLR		CQQCEDQQRE
EATRLQGELE		KLRKEWNALE		TECHSLKREN		VLLSSELQRQ		EKELHNSQKQ
SLELTSDLSI		LQMSRKELEN		QVGSLKEQHL		RDSADLKTLL		SKAENQAKDV
QKEYEKTQTV		LSELKLKFEM		TEQEKQSITD		ELKQCKNNLK		LLREKGNNKP
WPWMPMLAAL		VAVTAIVLYV		PGLARASP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Див. також

• Хромосома 3