SMU1

SMU1
Ідентифікатори
Символи	SMU1, BWD, SMU-1, fSAP57, smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans), DNA replication regulator and spliceosomal factor, DNA replication regulator and spliceosomal factor, SMU1 DNA replication regulator and spliceosomal factor
Зовнішні ІД	OMIM: 617811 MGI: 1915546 HomoloGene: 10079 GeneCards: SMU1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55234	74255
Ensembl	ENSG00000122692	ENSMUSG00000028409
UniProt	Q2TAY7	Q3UKJ7
RefSeq (мРНК)	NM_018225	NM_021535
RefSeq (білок)	NP_060695 NP_060695.2	NP_067510
Локус (UCSC)	Хр. 9: 33.04 – 33.08 Mb	Хр. 4: 40.74 – 40.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMU1 (англ. DNA replication regulator and spliceosomal factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 57 544.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSIEIESSDV		IRLIMQYLKE		NSLHRALATL		QEETTVSLNT		VDSIESFVAD
INSGHWDTVL		QAIQSLKLPD		KTLIDLYEQV		VLELIELREL		GAARSLLRQT
DPMIMLKQTQ		PERYIHLENL		LARSYFDPRE		AYPDGSSKEK		RRAAIAQALA
GEVSVVPPSR		LMALLGQALK		WQQHQGLLPP		GMTIDLFRGK		AAVKDVEEEK
FPTQLSRHIK		FGQKSHVECA		RFSPDGQYLV		TGSVDGFIEV		WNFTTGKIRK
DLKYQAQDNF		MMMDDAVLCM		CFSRDTEMLA		TGAQDGKIKV		WKIQSGQCLR
RFERAHSKGV		TCLSFSKDSS		QILSASFDQT		IRIHGLKSGK		TLKEFRGHSS
FVNEATFTQD		GHYIISASSD		GTVKIWNMKT		TECSNTFKSL		GSTAGTDITV
NSVILLPKNP		EHFVVCNRSN		TVVIMNMQGQ		IVRSFSSGKR		EGGDFVCCAL
SPRGEWIYCV		GEDFVLYCFS		TVTGKLERTL		TVHEKDVIGI		AHHPHQNLIA
TYSEDGLLKL		WKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9