SNAP23

SNAP23
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NHL, 3ZUS
Ідентифікатори
Символи	SNAP23, HsT17016, SNAP-23, SNAP23A, SNAP23B, synaptosome associated protein 23kDa, synaptosome associated protein 23
Зовнішні ІД	OMIM: 602534 MGI: 109356 HomoloGene: 37857 GeneCards: SNAP23
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • синапс • Нуклеоплазма • Міжклітинні контакти • SNARE complex • azurophil granule • specific granule • neuron projection • екзосома • presynapse • mast cell granule • phagocytic vesicle membrane • specific granule membrane • tertiary granule membrane Біологічний процес • histamine secretion by mast cell • vesicle targeting • synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane • membrane fusion • post-Golgi vesicle-mediated transport • synaptic vesicle priming • protein transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • neutrophil degranulation • GO:0015915 транспорт • екзоцитоз • vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8773	20619
Ensembl	ENSG00000092531	ENSMUSG00000027287
UniProt	O00161	O09044
RefSeq (мРНК)	NM_003825 NM_130798	NM_001177792 NM_001177793 NM_009222
RefSeq (білок)	NP_003816 NP_570710	NP_001171263 NP_001171264 NP_033248
Локус (UCSC)	Хр. 15: 42.49 – 42.55 Mb	Хр. 2: 120.4 – 120.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAP23 (англ. Synaptosome associated protein 23) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 23 354.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDNLSSEEIQ		QRAHQITDES		LESTRRILGL		AIESQDAGIK		TITMLDEQKE
QLNRIEEGLD		QINKDMRETE		KTLTELNKCC		GLCVCPCNRT		KNFESGKAYK
TTWGDGGENS		PCNVVSKQPG		PVTNGQLQQP		TTGAASGGYI		KRITNDARED
EMEENLTQVG		SILGNLKDMA		LNIGNEIDAQ		NPQIKRITDK		ADTNRDRIDI
ANARAKKLID		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах.

Див. також

• Хромосома 15

Література

• Ravichandran V., Chawla A., Roche P. A. (1996). Identification of a novel syntaxin- and synaptobrevin/VAMP-binding protein, SNAP-23, expressed in non-neuronal tissues. J. Biol. Chem. 271: 13300—13303. PMID 8663154 DOI:10.1074/jbc.271.23.13300
• Mollinedo F., Lazo P. A. (1997). Identification of two isoforms of the vesicle-membrane fusion protein SNAP-23 in human neutrophils and HL-60 cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 231: 808—812. PMID 9070898 DOI:10.1006/bbrc.1997.6196
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Polgar J., Chung S. H., Reed G. L. (2002). Vesicle-associated membrane protein 3 (VAMP-3) and VAMP-8 are present in human platelets and are required for granule secretion. Blood. 100: 1081—1083. PMID 12130530 DOI:10.1182/blood.V100.3.1081
• Freedman S. J., Song H. K., Xu Y., Sun Z. Y., Eck M. J. (2003). Homotetrameric structure of the SNAP-23 N-terminal coiled-coil domain. J. Biol. Chem. 278: 13462—13467. PMID 12556468 DOI:10.1074/jbc.M210483200